结论：公司通常应仅持有一枚经公安机关备案的正式公章，但根据实际业务需要，可设立其他特定用途的印章，如财务专用章、合同专用章等。不过，持有两枚或以上公章（尤其是未经备案的）存在管理和法律风险，需谨慎处理。

一、正式公章的唯一性

1. 法律效力：正式公章（行政章/法人章）是公司对外行使权力的最高象征，具有最高的法律效力。它常用于签订重要合同、协议，出具证明文件、公文等，能够代表公司的意志和行为。因此，从法律效力和管理便利性的角度出发，公司通常应仅持有一枚正式公章。

2. 备案要求：根据相关规定，公司刻制公章需向公安机关备案，以确保公章的合法性和唯一性。未经备案私自刻制多枚公章可能涉嫌违法，并可能面临治安管理处罚。

二、特定用途印章的设立与管理

1. 设立必要性：除正式公章外，公司可根据业务需要设立其他特定用途的印章，如财务专用章、合同专用章、发票专用章等。这些印章在各自特定的业务范围内具有相应的法律效力，有助于公司业务的顺利开展。

2. 管理要求：

   • 明确使用范围：公司应明确各个印章的使用范围、管理责任和使用程序，防止滥用或盗用。例如，财务专用章应仅用于财务往来结算，合同专用章应仅用于签订经济合同等。
   • 专人保管：公章应由专门的部门或人员负责保管和使用，并登记每次使用的详细情况，包括使用时间、使用事项、使用人等。这有助于确保公章的安全可控，并便于追踪和审计。
   • 定期审计与检查：公司应定期对公章的使用情况进行审计和检查，及时发现和纠正存在的问题。对于违反公章管理制度的行为，应依法依规进行处理，以维护公司的合法权益和交易安全。

三、持有两枚或以上公章的风险

1. 合法性问题：未经备案私自刻制多枚公章可能涉嫌违法，并可能面临治安管理处罚。此外，多枚公章可能导致内部管理混乱，文件、合同等法律文件不一致，难以追踪。

2. 法律效力问题：备案公章在各类民事法律行为、经济往来、诉讼活动中具有当然的法律效力。而未经备案的公章，其效力认定复杂，若相对人有合理理由相信该公章代表公司意思表示，或公司进行了追认，则可能被认定为有效；否则，可能不对公司具有约束力。

3. 欺诈风险：多枚公章增加了被不法分子盗用或滥用的风险，可能被用于签署虚假合同、伪造文件等违法行为，给公司带来不必要的法律纠纷和经济损失。

四、建议与措施

1. 统一公章管理：公司应建立严格的公章管理制度，确保仅持有一枚合法有效的公章（或明确少数几枚公章的具体用途和使用权限）。这有助于降低管理成本和法律风险。

2. 加强内部控制：公司应确保公章的使用符合公司的授权和审批流程，对于需要使用公章的文件或合同，应经过相关部门或人员的审核和批准。这有助于防止公章的滥用和盗用。

3. 法律风险防范：在使用公章时，公司应严格遵守相关法律法规和合同约定。对于重要的法律文件，建议咨询专业律师进行审查和指导，以确保其合法性和有效性。

4. 及时清理与备案：对于不再使用的公章，公司应及时按照规定程序进行销毁，并办理相关备案注销手续。如果有新的业务用章需要启用，要确保依法依规进行备案。

总结：公司通常应仅持有一枚经公安机关备案的正式公章，但可根据实际业务需要设立其他特定用途的印章。持有两枚或以上公章（尤其是未经备案的）存在管理和法律风险，需谨慎处理。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。