结论：网贷逾期90天后一次性还清，并不意味着可以全部减免违约金，具体能否减免以及减免的幅度，需根据贷款合同的具体条款、贷款机构的政策以及相关法律法规的规定来确定。

分析说明：

1. 贷款合同条款：

   • 贷款合同是借款人与贷款机构之间约定权利义务的法律文件。合同中通常会明确约定逾期还款的违约责任，包括违约金的计算方式和支付条件。
   • 如果合同中明确规定了逾期90天后一次性还清可以减免全部违约金，那么借款人就有权要求贷款机构按照合同约定执行。
   • 如果合同中没有此类规定，或者规定不明确，那么借款人就不能直接要求减免全部违约金。

2. 贷款机构政策：

   • 除了合同条款外，贷款机构也可能有自己的内部政策来处理逾期还款的情况。这些政策可能包括减免部分违约金、延长还款期限、提供分期还款方案等。
   • 借款人可以主动与贷款机构沟通，了解其政策，并尝试协商减免违约金的事宜。但需要注意的是，贷款机构是否同意减免以及减免的幅度，最终取决于其内部决策和风险评估。

3. 相关法律法规：

   • 在处理网贷逾期还款问题时，还需要考虑相关法律法规的规定。例如，《中华人民共和国民法典》中关于借款合同的规定，以及关于违约金计算和支付的相关规定。
   • 如果贷款机构收取的违约金过高或存在其他违法行为，借款人可以依法维护自己的权益，包括要求减免不合理的违约金部分。

法律建议：

• 仔细审查贷款合同：借款人应仔细审查贷款合同中的相关条款，了解逾期还款的违约责任和违约金的计算方式。
• 主动与贷款机构沟通：在逾期还款后，借款人应主动与贷款机构沟通，说明自己的还款意愿和实际情况，并尝试协商减免违约金的事宜。
• 依法维护权益：如果贷款机构拒绝减免违约金或存在其他违法行为，借款人可以依法向相关部门投诉或寻求法律援助，维护自己的合法权益。

后续行动与可能后果：

• 如果借款人能够与贷款机构达成减免违约金的协议，应确保协议内容明确、合法，并妥善保存相关证据。
• 如果借款人未能与贷款机构达成协议，或者贷款机构存在违法行为，借款人可能需要通过法律途径来解决争议。这可能包括提起诉讼或申请仲裁等，具体取决于合同中的争议解决条款和相关法律法规的规定。在此过程中，借款人应咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到充分保护。