结论：关于村里土地在2000年之前以租用形式建设厂房40年是否合法，以及村里是否有权利收回的问题，这主要取决于租赁合同的合法性、租赁期限的法律规定以及是否存在合同解除或收回土地的法定事由。以下是对这两个问题的详细分析：

一、租赁合同的合法性

1. 合同签订程序：首先，需要确认租赁合同的签订是否遵循了法定程序，包括是否经过了村民会议或村民代表会议的讨论通过，是否报经了乡镇人民政府批准等。如果合同签订程序合法，那么合同本身在形式上就是合法的。

2. 合同内容：其次，要审查合同内容是否合法。合同中应明确租赁土地的用途、租赁期限、租金及支付方式等关键条款。如果合同内容违反了法律法规的强制性规定，如将农用地用于非农业建设且未办理相关审批手续，那么合同可能被视为无效。

二、租赁期限的法律规定

1. 法定租赁期限：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，租赁期限不得超过二十年。超过二十年的，超过部分无效。因此，如果租赁合同中约定的租赁期限为40年，那么超过20年的部分将不受法律保护。

2. 续租问题：如果租赁期限届满后，双方当事人希望继续租赁，可以续订租赁合同。但续订的租赁合同同样受到二十年期限的限制。

三、村里是否有权利收回土地

1. 合同解除事由：如果租赁合同中约定了合同解除的事由，如承租人未按照约定支付租金、擅自改变土地用途等，那么村里在符合合同约定的情况下有权解除合同并收回土地。

2. 法定解除事由：即使合同中没有约定解除事由，如果承租人存在严重违约行为或违法行为，如将租赁土地用于非法活动、严重破坏土地等，村里也可以根据法律规定解除合同并收回土地。

3. 租赁期限届满：如果租赁期限届满且双方未续订租赁合同，那么村里自然有权收回土地。

四、特殊情况考虑

• 历史遗留问题：如果租赁合同是在2000年之前签订的，且当时的相关法律法规对租赁期限等问题的规定与现在不同，那么还需要考虑历史遗留问题的处理。在这种情况下，可能需要结合当时的法律法规和政策来综合判断合同的合法性和有效性。

• 政策变化：如果租赁期间相关政策发生了变化，如土地用途调整、土地征收等，那么也可能影响合同的履行和土地的收回问题。在这种情况下，需要密切关注政策变化并及时调整合同内容或采取相应措施。

建议：

• 如果村里或承租人对租赁合同的合法性、租赁期限或土地收回问题存在疑问，建议及时咨询专业律师进行法律分析和风险评估。
• 在签订或续订租赁合同时，应明确约定租赁期限、租金支付方式、合同解除事由等关键条款，以避免未来可能出现的纠纷。
• 如果租赁期间出现政策变化或合同履行问题，应及时与对方沟通协商并寻求解决方案。

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