当事业单位员工因病长期不能上班时，确实需要遵循一定的流程和规定来保障自己的权益。以下是我为您详细梳理的处理步骤和建议：
一、及时履行请假手续
口头报备：一旦发现身体不适，应立即通过电话、短信或即时通讯工具向直属领导说明情况，表达歉意并明确请假意向。例如：“领导，我今天身体不舒服，无法到岗工作，已经去医院就诊，特向您申请病假。”
提交书面证明：病情稳定后，通常需要在3个工作日内补交医疗机构出具的《诊断证明书》或《病假建议书》，这些文件应明确注明建议休息的天数。同时，部分单位可能还要求填写制式的《病假申请表》，并经过科室负责人签字确认。
二、确定医疗期及待遇
医疗期确定：根据国家相关规定，医疗期的长度取决于您的实际工作年限和在本单位的工作年限。一般来说，实际工作年限10年以下的，本单位工龄5年以内为3个月，5年以上为6个月。医疗期是您因病需要停止工作治病休息的时间，单位在这段时间内不得单方面解除劳动合同。
工资待遇：在医疗期内，单位应支付您不低于当地最低工资标准80%的病假工资或疾病救济费。具体标准可能因单位规定而有所不同，但不得低于这个最低标准。
三、遵守单位考勤制度
规范请销假流程：长期病假需要定期（如每月）更新医疗证明，以确保假期的连续性。如果超期未续假，单位可能会按旷工处理。返岗前，您需要提交康复证明并完成销假登记。
工作交接：如果您担任的是重要岗位，应在请假前完成紧急事务的交接工作，并指定临时联系人，保持通讯畅通，以便单位在需要时能够及时联系到您。
四、特殊情况应对
突发急症处理：如果您遇到突发急症，可以先就医后补假。但务必在就诊当日完成口头报备，并在48小时内补交急诊病历等相关证明材料。
丧失劳动能力处理：如果您的病情严重，经劳动能力鉴定委员会鉴定确认丧失劳动能力，且符合相关条件（如工作年限满十年，男年满五十周岁、女年满四十五周岁），您可以办理退休手续；如果工作年限不满十年，则按退职办理，享受相应的养老待遇。
争议解决途径：如果您对单位的处理决定有异议，可以先向单位内部的人事部门反映情况，申请复核。如果对复核结果仍不满意，您可以向当地的人事争议仲裁机构申请仲裁，或向相关的人事管理部门申诉。
五、保留相关证据
在整个过程中，您应妥善保管好所有相关证据，包括医疗证明、劳动合同、工资条、请假记录等。这些证据在必要时将作为维护自身合法权益的重要依据。
总之，当事业单位员工因病长期不能上班时，应及时履行请假手续、确定医疗期及待遇、遵守单位考勤制度、应对特殊情况，并保留好相关证据。同时，与单位保持良好沟通并寻求双方都能接受的解决方案也是至关重要的。希望这些建议能对您有所帮助。