在结算报甲方后发现遗漏项目，这是一个涉及工程量清单缺陷的问题，需要结合合同约定、法律法规以及工程实际情况来妥善处理。以下是我为您提供的详细解答：

一、明确遗漏项目的类型及责任归属

1. 遗漏项目类型：

   • 漏项：清单中未包含图纸或规范要求的施工内容。
   • 工程量偏差：清单中的工程量与实际完成的工程量存在显著差异。

2. 责任归属：

   • 根据《建设工程工程量清单计价规范》及相关法律法规，工程量清单的准确性和完整性通常由发包人（甲方）负责。若因清单缺项、漏项导致结算争议，发包人应修正清单并调整合同价格。
   • 然而，如果合同中明确约定了承包人（乙方）在投标时有核对清单的义务，并且承包人未在约定时间内提出疑问，那么承包人也可能需要承担一定责任。但需注意，若合同中的此类条款免除了发包人的法定义务，则可能被视为无效。

二、分场景处理策略

1. 单价合同场景：

   • 若发现遗漏项目，且该项目属于实际施工内容，应按实际施工量进行结算。
   • 对于新增项目，若合同中有类似项目价格可参考，则按类似项目价格结算；若无类似项目价格，则可参考市场价或双方协商确定单价。

2. 总价合同场景：

   • 若遗漏项目属于图纸范围内，且承包人能证明该漏项导致了成本增加，那么承包人有权向发包人索赔。
   • 若遗漏项目属于图纸外的变更，则需要双方协商签订补充协议，明确新增项目的价格及结算方式。

三、操作流程与证据留存

1. 缺陷识别与记录：

   • 仔细核对竣工图、施工记录及变更签证，明确遗漏项目的具体内容及影响范围。
   • 保存好图纸、合同、招标文件等原始资料，作为后续处理争议的依据。

2. 沟通与变更程序：

   • 及时与发包人沟通，确认遗漏项目的情况。
   • 按照合同约定的变更程序提交变更申请，明确修正内容、费用及工期调整等事项。
   • 若涉及重大变更，需签订补充协议并履行审批程序。

3. 审计应对策略：

   • 在审计过程中，重点核查工程量计算规则、定额套用及材料价格等，确保结算的准确性。
   • 对于争议项，可采用实地勘查、拍照取证等方式还原施工实际情况，为结算提供有力支持。

四、风险防范建议

1. 编制阶段：

   • 发包人应委托专业团队编制工程量清单，并实行三级审核制度，确保清单的准确性和完整性。
   • 承包人在投标时应仔细核对图纸与清单的一致性，对疑似缺陷提出书面质疑。

2. 合同条款：

   • 在合同中明确清单错误的责任归属，合理分配风险，避免绝对化表述（如“投标人自行承担清单错误”）。
   • 约定清单误差率超过一定范围时自动触发价格调整机制，以减少后期争议。

3. 动态管理：

   • 在施工过程中定期核对工程量，及时处理变更签证，减少后期结算时的争议。
   • 采用BIM模型或工程量计算软件等工具进行交叉核量，提高结算的准确性和效率。

综上所述，处理结算报甲方后发现的遗漏项目需要兼顾法律依据、合同约定及工程实际情况。通过规范流程、充分举证和明确责任，可以维护各方的合法权益，避免因清单缺陷演变为结算僵局。