您已还清三年前的贷款且从未逾期，却收到催收短信，这种情况可能存在以下几种原因，我将分情况为您详细说明：
信息错误或系统故障
金融机构的催收系统可能因技术故障、数据更新延迟或人工录入错误，导致将催收信息误发至您的号码。例如，其他借款人预留的联系方式与您的号码相似，或系统未及时更新您的还款状态。
建议：首先核对短信内容中的贷款机构名称、合同编号等信息，确认是否与您曾办理的贷款相关。若确认无关，可直接联系该机构客服，要求核实并更正信息，同时保留通话记录或书面回复作为证据。
身份信息被盗用
若您曾丢失身份证或泄露过个人信息，可能存在不法分子冒用您的身份办理贷款并逾期的情况。此时催收机构虽非针对您本人，但因信息关联错误导致短信发送至您的手机。
建议：立即通过中国人民银行征信中心查询个人信用报告，确认是否存在未知贷款记录。若发现异常，需第一时间向当地公安机关报案，并联系贷款机构说明情况，要求停止催收并修正征信记录。
第三方催收公司的违规操作
部分贷款机构会将逾期债务委托给第三方催收公司，而某些催收公司可能因管理混乱或为完成业绩，采用“广撒网”方式发送催收短信，甚至对已还清债务的借款人进行骚扰。
建议：要求催收方提供您的贷款合同、还款明细等证明材料。若对方无法提供或您已还清债务，可明确告知其停止骚扰，并保留短信、通话记录等证据。若对方继续骚扰，可向贷款机构投诉或向当地银保监会、金融监管局举报。
贷款机构内部流程问题
少数情况下，贷款机构可能因内部流程疏漏（如未及时标记还款状态、档案归档错误等），导致系统仍认为您存在未结清债务，从而触发催收流程。
建议：直接联系原贷款机构（如银行、消费金融公司等），提供还款凭证（如银行流水、结清证明等），要求其核查并出具书面确认函，明确债务已结清。若机构拒绝配合，可向其上级监管部门投诉。
最后提醒：无论何种原因，您均有权要求催收方停止侵权行为。若短信内容涉及威胁、辱骂或泄露个人信息等违法行为，可向公安机关报案并保留证据。如有进一步疑问，欢迎随时向我咨询。