核心结论：当发票额度对方未配合合同确认时，您可以通过以下方式解决：

1. 核查合同条款，明确双方权利义务
   首先，仔细审查合同中关于发票开具的具体约定，包括发票类型、金额、开具时间、双方配合义务等条款。若合同已明确约定对方需配合确认发票额度（例如需签字确认或书面回复），而对方未履行，则对方可能构成违约。此时可依据合同条款，通过书面催告（如律师函、邮件等）要求对方限期配合，并保留催告证据作为后续维权依据。

2. 协商补充协议或书面确认
   若合同未明确约定确认流程，或对方以“内部流程复杂”等理由拖延，可主动与对方协商补充协议，明确发票额度的确认方式（如指定对接人、限定确认期限等），或要求对方出具书面确认文件（如加盖公章的确认函）。补充协议或书面确认可降低后续纠纷风险，同时作为交易真实性的证据。

3. 留存交易证据，防范税务风险
   即使对方未配合确认，您仍需确保发票开具的合规性。建议留存以下证据：

   • 合同原件及履行凭证（如送货单、验收单、付款记录等）；
     
   • 与对方沟通确认发票额度的记录（如邮件、微信、录音等）；
     
   • 对方实际接受发票的证据（如签收单、物流记录等）。
     这些证据可证明交易真实性，避免被税务机关认定为“虚开发票”，同时为后续可能的法律纠纷提供支持。

4. 通过法律途径解决争议
   若对方长期拒绝配合且协商无果，您可依据《民法典》第五百七十七条（违约责任）向法院起诉，要求对方履行配合义务或赔偿损失。若对方行为已影响您正常经营（如导致无法抵扣税款），还可主张因违约造成的实际损失（如滞纳金、额外税负等）。诉讼前建议委托律师发送正式律师函，以增加对方履约压力。

温馨提示：发票问题涉及税务合规与合同履行双重风险，建议优先通过协商或补充协议解决。若对方态度强硬或涉及金额较大，可随时向我咨询具体应对方案，我将结合合同条款与实务经验为您制定策略。