在申请国籍认定书时，若存在血缘关系争议或无法通过常规文件证明亲子关系，通常需要提供亲子鉴定书作为有效证据。具体来说，以下情况通常需要亲子鉴定书：

1. 出生证明缺失或信息不全：当申请人的出生证明缺失、信息不完整或存在疑问时，例如出生证明上未明确记载父母信息，或者记载的信息与实际情况不符，此时需要通过亲子鉴定来确认亲子关系，从而支持国籍认定申请。

2. 非婚生子女申请国籍：对于非婚生子女，如果父母未在子女出生时进行婚姻登记，或者父母对子女的亲子关系存在争议，那么在申请国籍认定书时，可能需要提供亲子鉴定书来证明亲子关系的真实性。

3. 收养关系申请国籍：在收养情况下，如果收养人希望为被收养人申请国籍认定书，且收养关系未经过法律程序确认或存在争议，那么亲子鉴定书可以作为证明收养关系与亲子关系的重要证据。

4. 国籍继承争议：当存在国籍继承争议时，例如父母双方或一方具有外国国籍，而子女希望继承中国国籍，或者相反情况，此时可能需要通过亲子鉴定来确认亲子关系，从而解决国籍继承问题。

5. 法律程序要求：在某些特定情况下，法律可能明确规定在申请国籍认定书时必须提供亲子鉴定书。这通常是为了确保国籍认定的准确性和公正性，防止因亲子关系不明确而导致的国籍纠纷。