若审核单位不承认电子印章，可采取以下措施来应对和解决这一问题：
确认电子印章的合法性与有效性
- 法律依据：根据《中华人民共和国电子签名法》的相关规定，电子印章与手写签名或者盖章具有同等的法律效力，但前提是电子印章必须符合法律规定的条件，即能够有效地表现所载内容并可供随时调取查用，能够可靠地保证电子印章自最终形成时起，内容保持完整、未被更改。
- 操作建议：首先，应确认所使用的电子印章是否由依法设立的电子认证服务提供者提供，并确保其符合上述法律条件。若电子印章合法有效，可向审核单位提供相关法律条文及电子印章的认证证书，以证明其法律效力。
与审核单位沟通协商
- 沟通策略：在确认电子印章合法有效的基础上，主动与审核单位进行沟通，了解其不承认电子印章的具体原因。可能是审核单位对电子印章的认知不足，或者存在其他技术、流程上的障碍。
- 解决方案：针对审核单位提出的问题，提供详细的解释和说明，包括电子印章的制作、使用、验证等流程。若审核单位仍持怀疑态度，可提议进行现场演示或提供第三方认证机构的报告，以消除其顾虑。
寻求法律途径解决
- 法律途径：若与审核单位的沟通协商无果，且确认电子印章确实合法有效，可考虑通过法律途径解决争议。这包括向相关行政部门投诉、申请行政复议或提起行政诉讼等。
- 操作建议：在采取法律途径前，应收集并整理好相关证据材料，如电子印章的认证证书、使用记录、与审核单位的沟通记录等。同时，咨询专业律师，了解具体的法律程序和可能的风险，以便制定合适的诉讼策略。
考虑替代方案
- 替代方案：在解决争议的过程中，也可考虑使用其他形式的印章或签名作为替代方案，如手写签名、盖章等。但需注意，替代方案应确保与原电子印章具有同等的法律效力，并符合相关法律法规的规定。
- 风险提示：使用替代方案时，应谨慎评估其可能带来的法律风险和后果。例如，手写签名或盖章可能存在被伪造的风险，因此需采取必要的防范措施。
在处理此类问题时，还需注意以下几点：
- 保持冷静与理性：面对审核单位的不承认，应保持冷静与理性，避免情绪化的反应。通过合法、合理的途径解决问题，是维护自身权益的关键。
- 及时咨询专业律师：在处理涉及法律问题的争议时，及时咨询专业律师是非常重要的。律师能够提供专业的法律意见和帮助，确保你的权益得到充分保障。
若你在处理此类问题时遇到任何困难或疑问，可直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供针对性的法律建议。