结论：房产由当事人申请法院查封后，被执行人履约后，房产仍被长期查封一般是违法的。下面从不同角度为你详细分析：

法律规定角度

根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第二十八条规定，有下列情形之一的，人民法院应当作出解除查封、扣押、冻结裁定，并送达申请执行人、被执行人或者案外人：

1. 查封、扣押、冻结案外人财产的：如果被查封的房产实际上属于案外人，在被执行人履约后，继续查封显然违法，应当及时解除查封。
2. 申请执行人撤回执行申请或者放弃债权的：当申请执行人主动撤回申请或者放弃债权时，意味着其不再需要通过查封房产来实现自己的权益，此时继续查封房产就缺乏了合法依据，属于违法行为。
3. 查封、扣押、冻结的财产流拍或者变卖不成，申请执行人和其他执行债权人又不同意接受抵债的：在这种情况下，继续查封房产已经没有实际意义，应当解除查封。
4. 债务已经清偿的：这是与本题情况最为相关的情形。当被执行人已经履行了相应的义务，即债务已经清偿，那么继续查封房产就违反了法律规定，法院应当及时解除查封措施。

实际操作角度

在司法实践中，一旦被执行人履行了义务，通常有两种方式来解除查封：

1. 申请执行人申请解除：申请执行人在确认被执行人已经履约后，可以向法院提出申请，要求解除对房产的查封。法院在收到申请后，会进行审查，如果确认债务已经清偿，就会作出解除查封的裁定。
2. 被执行人申请解除：被执行人认为自己已经履行了义务，也可以向法院提出解除查封的申请。法院同样会进行审查，如果情况属实，就会解除查封。

如果房产在被执行人履约后仍被长期查封，可能存在以下问题：

1. 信息沟通不畅：可能是申请执行人没有及时向法院反馈被执行人已经履约的情况，或者被执行人没有及时向法院提出解除查封的申请，导致法院不知道债务已经清偿，从而没有及时解除查封。
2. 法院工作疏忽：法院在处理大量案件的过程中，可能会出现工作疏忽，没有及时对符合解除查封条件的房产进行解封。

法律后果角度

如果房产在被执行人履约后仍被长期违法查封，被执行人可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 向法院提出异议：被执行人可以向执行法院提出书面异议，说明房产已经被违法查封的情况，并提供相关证据，如债务清偿的凭证等。法院会在收到异议后进行审查，并在十五日内作出裁定。
2. 申请国家赔偿：如果因为违法查封给被执行人造成了损失，被执行人可以在符合国家赔偿的条件下，向法院申请国家赔偿。根据《中华人民共和国国家赔偿法》的规定，行使侦查、检察、审判职权的机关以及看守所、监狱管理机关及其工作人员在行使职权时侵犯人身权、财产权的，受害人有取得赔偿的权利。

建议：如果遇到房产在被执行人履约后仍被长期查封的情况，你可以先与申请执行人沟通，确认其是否已经向法院申请解除查封。如果沟通无果，你可以向执行法院提出书面异议，并提供相关证据，要求法院解除查封。如果因为违法查封给你造成了损失，你还可以考虑申请国家赔偿。如果你还有其他疑问，可以直接向我咨询。