针对您提出的“服刑人员退赃没退完申报减刑时会不会查配偶的银行卡流水”这一问题，以下是我的详细解答：

在刑事案件中，特别是涉及退赃的环节，司法机关有明确的职责去查明犯罪所得的去向及数额。这是为了确保案件的公正处理，以及犯罪所得能够得到妥善的追缴。

当服刑人员未足额退赃时，司法机关为了确定犯罪所得的实际金额、流向，以及未足额退赃的具体原因，有权进行进一步的侦查取证。这其中，查询服刑人员及其相关人员的银行流水等财产信息，是侦查取证中常用的手段之一。这里的“相关人员”，在特定情况下，确实可能包括服刑人员的配偶。

具体来说，如果司法机关怀疑服刑人员可能存在转移、隐匿赃款的情况，或者为了更全面地了解案件情况，他们可能会决定查询服刑人员配偶的银行流水。这样做的目的，是为了更准确地掌握资金往来情况，从而判断退赃的真实情况。

此外，需要强调的是，如果服刑人员有能力退赃却未退完，这可能会对其量刑产生影响。在申报减刑时，司法机关会综合考虑服刑人员的退赃情况、认罪态度、改造表现等多个因素。因此，服刑人员应积极配合司法机关的退赃工作，以争取从轻处理。

综上所述，服刑人员退赃没退完时，司法机关在申报减刑的过程中，为了查明犯罪所得的去向及数额，确实有可能查询其配偶的银行卡流水。这是司法机关履行职责、确保案件公正处理的需要。希望这一解答能够对您有所帮助。