宅基地纠纷村里调解签的协议书，若需申请司法鉴定，可按以下步骤进行：

1. 明确鉴定目的与内容：

   • 首先，需要明确申请司法鉴定的具体目的，比如是为了确认协议书的真实性（包括签署时间、签署人身份等）、完整性（是否有篡改、遗漏等），还是为了确认协议书中的某些特定内容（如宅基地的边界、面积等）的准确性。
   • 根据鉴定目的，确定需要鉴定的具体内容，这是后续选择鉴定机构和鉴定方法的基础。

2. 选择合适的鉴定机构：

   • 司法鉴定应由具有相应资质的鉴定机构进行。对于宅基地纠纷协议书的鉴定，可能需要选择具有文件鉴定、痕迹鉴定或土地测绘等资质的鉴定机构。
   • 可以通过查询当地司法行政部门的官方网站或咨询相关法律服务机构，了解并选择合适的鉴定机构。

3. 提交鉴定申请及相关材料：

   • 向选定的鉴定机构提交书面鉴定申请，明确鉴定请求、鉴定目的和鉴定内容。
   • 同时，需要提交与鉴定相关的材料，包括但不限于：协议书原件或复印件、双方当事人的身份证明、与协议书相关的其他证据材料（如宅基地使用权证、土地测绘图等）。

4. 配合鉴定机构进行鉴定：

   • 根据鉴定机构的要求，可能需要双方当事人到场进行询问、指认或提供其他必要的协助。
   • 鉴定机构在收到申请和相关材料后，会进行初步审查，并决定是否受理鉴定申请。若受理，则会按照规定的程序进行鉴定，并出具鉴定意见书。

5. 处理鉴定意见书：

   • 鉴定意见书出具后，应仔细阅读并理解其内容。鉴定意见书通常会对鉴定目的、鉴定方法、鉴定结果等进行详细说明。
   • 根据鉴定意见书的结果，可以进一步采取相应的法律措施，如协商、调解、仲裁或诉讼等，以解决宅基地纠纷。

额外提醒：

• 在申请司法鉴定前，建议先尝试通过协商、调解等方式解决纠纷，以节省时间和成本。
• 若纠纷涉及复杂的法律问题或鉴定结果对纠纷解决具有关键性影响，建议在申请司法鉴定前咨询专业律师，以确保鉴定申请的合理性和有效性。

如有其他关于宅基地纠纷或司法鉴定的疑问，可以直接向我咨询。