火车站出发层违停是会被罚款的，具体分析如下：

1. 违停行为的违法性：火车站出发层通常属于交通繁忙区域，设有明确的交通标志和标线，以规范车辆行驶和停放。违停行为违反了《中华人民共和国道路交通安全法》及其相关实施条例中关于车辆停放的规定，因此是违法的。

2. 罚款的法律依据：根据《道路交通安全法》第九十三条，对违反道路交通安全法律、法规关于机动车停放、临时停车规定的，可以指出违法行为，并予以口头警告，令其立即驶离。机动车驾驶人不在现场或者虽在现场但拒绝立即驶离，妨碍其他车辆、行人通行的，处二十元以上二百元以下罚款，并可以将该机动车拖移至不妨碍交通的地点或者公安机关交通管理部门指定的地点停放。在火车站出发层违停，很可能因妨碍交通而被罚款。

3. 实际执法情况：在实际执法中，交警部门会根据违停的具体情况，如违停时间、地点、是否妨碍交通等因素，来决定是否罚款以及罚款的金额。火车站出发层作为交通枢纽，违停行为往往更容易受到交警的关注和处罚。

4. 特殊情况下的处理：如果违停行为是由于特殊原因（如紧急情况、车辆故障等）造成的，并且驾驶人能够及时采取措施消除违停状态，交警部门可能会根据实际情况进行酌情处理，如口头警告而不罚款。但这并不意味着违停行为本身不违法或不受处罚。

建议：为了避免因违停而被罚款，驾驶人在火车站出发层等交通繁忙区域应严格遵守交通标志和标线的指示，规范停放车辆。如果确实需要临时停车，应选择合法的停车区域，并尽快驶离。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。