结论：被起诉后办理非柜面交易是否会被自动扣款，取决于多个因素，包括是否已被法院采取财产保全措施、是否签订了自动扣款协议以及银行或支付平台的具体操作规定等。以下是对这些因素的详细分析：

1. 法院财产保全措施：

   • 情况说明：若法院在诉讼过程中或判决后，根据债权人的申请，对您的银行账户采取了财产保全措施，如冻结账户，则无论您是否办理非柜面交易，账户内的资金都可能无法被自由支取或转账，包括自动扣款。
   • 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院有权根据当事人的申请，对可能因当事人一方的行为或者其他原因，使判决难以执行或者造成当事人其他损害的案件，根据对方当事人的申请，可以裁定对其财产进行保全、责令其作出一定行为或者禁止其作出一定行为。

2. 自动扣款协议：

   • 情况说明：如果您与银行或支付平台签订了自动扣款协议，且该协议在您被起诉后仍然有效，同时您的账户未被法院冻结，那么理论上，非柜面交易（如网上银行、手机银行等）中的自动扣款功能仍可能正常执行。
   • 风险提示：然而，需要注意的是，即使签订了自动扣款协议，如果账户余额不足或银行/支付平台因其他原因（如系统故障、安全风险等）暂停了自动扣款服务，也可能导致自动扣款失败。

3. 银行或支付平台的具体操作规定：

   • 情况说明：不同银行或支付平台对于非柜面交易和自动扣款的具体操作规定可能有所不同。一些平台可能在用户被起诉后，出于风险控制的考虑，暂停或限制其非柜面交易功能，包括自动扣款。
   • 建议操作：因此，如果您担心被起诉后非柜面交易会被自动扣款，建议您直接联系您的银行或支付平台，了解他们的具体操作规定和政策。

综合建议：

• 如果您已被起诉，且担心账户资金被自动扣款，首先应确认账户是否已被法院冻结。
• 其次，检查您与银行或支付平台签订的自动扣款协议，了解协议的具体内容和条款。
• 最后，直接联系银行或支付平台，咨询他们在您被起诉后的具体操作规定和政策，以便做出更合理的财务安排。

后续行动：

• 如果您需要更具体的法律建议或帮助，如申请解除财产保全、协商还款计划等，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。