结论：劳动者“自离”后，对于其已经付出的劳动，用人单位仍然有义务支付相应的工资。不过，具体支付情况可能会受到劳动合同、公司规章制度以及法律法规中特殊规定的影响。若用人单位以“自离”为由拒绝支付工资，劳动者可通过法律途径维护自身权益。
法律背景与工资支付原则
基本原则：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这一规定为劳动者获取劳动报酬提供了坚实的法律保障。
- 同时，《工资支付暂行规定》第九条也明确指出，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这意味着，无论劳动者以何种方式离职，包括“自离”，用人单位都需支付其实际工作期间的工资。
特殊情况下的工资扣除：
- 如果劳动者的“自离”行为给用人单位造成了实际经济损失，如未办理工作交接导致项目延误、客户流失等，用人单位可以要求劳动者进行赔偿。但赔偿金额需从劳动者工资中合理扣除，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
劳动合同与公司规章制度的影响
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间约定权利义务的重要法律文件。如果劳动合同中有明确约定关于“自离”情况下工资支付的规定，如自离员工不享受某些福利待遇或奖金，但基本工资仍需支付，那么应当按照合同约定执行。但需注意，合同约定不得违反法律法规的强制性规定。
公司内部规章制度：
- 公司内部的员工手册或规章制度可能包含对“自离”行为的处理规定，如扣发工资、取消奖金等。然而，这些规定必须合法，不能违反国家法律法规。如果公司内部规定与法律法规相冲突，应以法律法规为准。例如，公司不能规定“自离”员工一律不发工资，这样的规定是无效的。
维权途径与建议
协商沟通：
- 面对用人单位以“自离”为由拒绝支付工资的情况，劳动者首先可以尝试与用人单位进行友好协商，明确工资数额及支付时间，争取和平解决纠纷。
投诉举报：
- 若协商无果，劳动者可向当地劳动监察部门投诉举报。投诉时，需提供相关证据材料，如工作记录、工资条、劳动合同等。劳动监察部门将依法进行调查处理，并责令用人单位支付工资。
申请劳动仲裁：
- 如劳动监察部门的处理未能满足劳动者的诉求，劳动者可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。通过仲裁程序，要求用人单位支付工资及可能的赔偿金。仲裁裁决具有法律效力，用人单位必须履行。
提起诉讼：
- 若劳动仲裁裁决后用人单位仍不履行义务，劳动者有权向人民法院提起诉讼。通过司法途径，进一步维护自身合法权益。
总结与提醒
“自离”并非意味着劳动者就失去了获得实际工作期间工资的权利。在处理此类问题时，劳动者应充分了解自己的法律权益，并综合考虑劳动合同、公司规章制度及法律法规的规定。同时，也建议劳动者在离职前与公司进行充分沟通，尽量按照法定程序和公司规定办理离职手续，以避免不必要的纠纷和损失。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。