在计时工资制下，加班工资的计算确实是一个涉及多个因素的问题，主要包括工时制度、加班类型以及小时工资基数等。下面我将为您详细解析在计时工资制下，特别是综合计时工资制下，加班工资的计算方法。

一、综合计时工资制的基本概念

综合计时工资制是一种以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间的工时制度。在这种制度下，平均日工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。但在综合计算周期内，某一具体日或周的实际工作时间可以超过8小时或40小时，只要总实际工作时间不超过总法定标准工作时间即可。

二、加班认定原则

在综合计时工资制下，加班的认定是基于劳动者在综合计算周期内实际工作时间是否超过法定标准工作时间。如果超过，则超出部分视为加班。但需要注意的是，若某个具体日或周的工作时间超标，但综合计算周期内总工作时间未超标，则一般不视为加班。

三、加班工资的计算基数

加班工资的计算基数是劳动者本人的小时工资。这个小时工资可以通过以下公式计算得出：

小时工资基数 = 月工资收入 ÷ 月计薪天数（通常为21.75天）÷ 8小时

四、加班工资的计算方法

根据加班类型的不同，加班工资的计算方法也有所区别：

1. 工作日延长工作时间加班：

   • 加班工资 = 小时工资基数 × 150% × 延长工作小时数
   • 示例：若小时工资基数为30元，某工作日延长工作时间2小时，则加班工资为90元。

2. 休息日加班：

   • 若不能安排补休，则支付加班工资。
   • 加班工资 = 小时工资基数 × 200% × 休息日加班小时数
   • 示例：若小时工资基数为30元，某休息日加班8小时，则加班工资为480元。

3. 法定节假日加班：

   • 无论是否在综合计算周期内，均支付加班工资。
   • 加班工资 = 小时工资基数 × 300% × 法定节假日加班小时数
   • 示例：若小时工资基数为35元，某法定节假日加班6小时，则加班工资为630元。

五、注意事项

1. 证据保存：劳动者应妥善保存加班证据，如考勤记录、工作记录等，以备劳动争议时使用。
2. 合同约定与企业规章制度：用人单位与劳动者可在劳动合同中明确加班工资的计算方式，但不得违反法律法规的强制性规定。
3. 延长工作时间限制：每月延长工作时间不得超过36小时，超时部分仍按150%计算加班工资。
4. 特殊行业规定：特殊行业、企业和工作岗位可能实行不同的综合工时制规定，计算加班工资时需考虑当地实际情况和相关规定。

综上所述，计时工资制下的加班工资计算需要严格遵循相关法律法规，并结合具体的工时制度和加班类型来确定。劳动者应了解自己的权益，确保在加班时能够获得合法的加班费。同时，用人单位也应遵守相关法律法规，合理支付劳动者的加班费用。希望这些信息能对您有所帮助！