结论：没有合同的情况下，承包方从实际施工人工程款里扣除企业所得税是否合法，需分情况讨论，一般情况下不合法，但若符合特定条件则可能合法。以下为详细分析：
一、一般情况下不合法
法律依据：
- 根据《中华人民共和国税收征收管理法》及相关税法规定，企业所得税的纳税义务人是企业本身，而非实际施工人。企业应当按照税法规定自行申报并缴纳企业所得税。
- 在没有合同明确约定的情况下，承包方无权直接从实际施工人的工程款中扣除企业所得税。这种行为可能构成对实际施工人财产权的侵犯。
实际操作：
- 实际施工人通常与承包方之间存在的是工程承包关系，而非税务代理关系。因此，承包方没有法律义务或权利代实际施工人缴纳企业所得税。
- 如果承包方擅自扣除企业所得税，实际施工人有权要求承包方返还被扣除的款项，并可能因此引发合同纠纷或税务纠纷。
二、特定条件下可能合法
合同约定：
- 如果承包方与实际施工人之间在合同中明确约定了承包方有权从工程款中扣除企业所得税，并且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种扣除行为可能是合法的。
- 但需要注意的是，合同中的这种约定必须明确、具体，并且双方当事人在签订合同时应当充分理解并同意这种约定。
税务合规：
- 即使合同中有相关约定，承包方在扣除企业所得税时也必须确保税务合规。这包括正确计算应纳税额、按时申报缴纳税款等。
- 如果承包方在扣除企业所得税时存在税务违规行为，如少报、漏报税款等，那么这种扣除行为仍然可能被视为不合法。
三、法律建议
审查合同：
- 实际施工人应当仔细审查与承包方签订的合同，确认合同中是否有关于企业所得税扣除的约定。
- 如果合同中没有相关约定或约定不明确，实际施工人有权拒绝承包方扣除企业所得税的要求。
咨询专业意见：
- 如果实际施工人对税务问题或合同条款存在疑问，建议咨询专业税务律师或会计师的意见，以确保自身权益不受侵害。
- 作为专业律师，我可以提供关于经济纠纷、合同纠纷领域的法律咨询，帮助实际施工人解决相关问题。
保留证据：
- 实际施工人应当保留好与承包方之间的所有交易记录、合同文件等证据，以备在发生纠纷时作为维权依据。
总结：没有合同的情况下，承包方从实际施工人工程款里扣除企业所得税一般是不合法的。但如果合同中有明确约定且符合税务合规要求，则可能合法。实际施工人应当仔细审查合同、咨询专业意见并保留好相关证据，以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。