结论：在对方公司已经工商注销的情况下，一般不能直接起诉该公司，但能否起诉其控股公司需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、公司注销后的法律地位
公司注销意味着其法人资格的终止，即公司作为法律主体的消亡。根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司注销后，其民事权利能力和民事行为能力均告消灭，因此，一般情况下，无法再以注销的公司为被告提起诉讼。
二、起诉控股公司的可能性
控股公司作为股东的责任：
- 如果控股公司作为注销公司的股东，存在未履行或未全面履行出资义务、抽逃出资、滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务等情形，根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，债权人可以要求控股公司在未出资或抽逃出资的本息范围内、滥用权利造成的损失范围内承担赔偿责任。
控股公司作为实际控制人的责任：
- 如果控股公司作为注销公司的实际控制人，利用关联关系损害公司利益，导致公司无法清偿债务，债权人也可以依据相关法律法规要求控股公司承担相应的赔偿责任。
特定情形下的直接起诉：
- 在某些特定情形下，如控股公司直接参与了注销公司的侵权行为或合同违约行为，且该行为与注销公司的债务存在直接关联，债权人可能有权直接起诉控股公司。但这需要具体分析案件事实和相关证据。
三、实际操作建议
收集证据：
- 在考虑起诉控股公司之前，应充分收集证据，证明控股公司存在上述应承担责任的情形。这包括但不限于公司章程、股东会决议、财务报表、银行转账记录、合同文件等。
咨询专业律师：
- 由于涉及复杂的法律关系和证据收集，建议咨询专业律师，以便更准确地评估案件风险和制定诉讼策略。虽然我不能直接给出联系方式，但你可以直接向我咨询相关法律问题。
考虑其他救济途径：
- 除了诉讼之外，还可以考虑通过和解、调解、仲裁等其他方式解决纠纷。这些方式可能更为高效、经济，且有助于维护双方的关系。
四、法律后果
- 如果成功起诉控股公司并获得胜诉判决，控股公司可能需要承担相应的赔偿责任，包括赔偿债务本金、利息、违约金以及诉讼费用等。
- 如果起诉失败或控股公司无力承担赔偿责任，债权人可能需要承担部分或全部损失。因此，在起诉前应充分评估风险并制定合理的诉讼策略。
综上所述，在对方公司已经工商注销的情况下，能否起诉其控股公司需视具体情况而定。建议你在充分收集证据并咨询专业律师后，再做出决策。如果你有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请随时向我咨询。