关于电脑店帮人激活系统是否违法以及如何处理的问题，这主要取决于激活系统的方式和所使用的激活工具或方法的合法性。
一、是否违法
合法激活：
- 如果电脑店使用的是官方提供的激活工具或方法，且用户拥有合法的系统授权（如购买了正版系统或获得了合法的授权许可），那么这种激活行为是合法的。
非法激活：
- 如果电脑店使用的是破解工具、盗版激活码或绕过官方激活机制的方法来激活系统，那么这种行为就可能构成违法。这侵犯了软件著作权人的权益，违反了著作权法等相关法律法规。
- 特别是当这种行为涉及大规模复制、分发或销售盗版软件时，还可能构成侵犯著作权罪，面临刑事处罚。
二、如何处理
合法经营：
- 电脑店应确保所使用的激活工具和方法是合法的，不侵犯任何第三方的权益。
- 应鼓励用户购买正版软件，并提供合法的激活服务。
面对非法激活的指控：
- 如果电脑店被指控非法激活系统，应首先核实所使用的激活工具和方法的合法性。
- 如果确实存在非法行为，应立即停止，并积极配合相关部门的调查和处理。
- 可以考虑与软件著作权人协商，寻求和解或赔偿等解决方案。
法律后果：
- 如果电脑店的非法激活行为被证实，可能面临民事侵权追责，如赔偿损失、消除影响等。
- 在情节严重的情况下，还可能触犯刑法，被依法追究刑事责任，如有期徒刑、罚金等。
三、建议
- 加强法律意识：电脑店应加强对著作权法等相关法律法规的学习，确保经营活动的合法性。
- 建立合规机制：建立内部合规机制，对所使用的软件和激活工具进行严格审核和管理。
- 积极应对调查：如果面临相关部门的调查，应积极配合，提供必要的证据和资料，以证明自身的合法性。
举例说明：假设某电脑店使用了一种破解工具来激活用户电脑上的操作系统，而这种工具是未经软件著作权人授权的。如果这种行为被软件著作权人发现并报警，电脑店就可能面临法律追究。在这种情况下，电脑店应立即停止使用该破解工具，并积极配合相关部门的调查和处理，以减轻可能的法律后果。
总之，电脑店在帮人激活系统时，必须确保所使用的激活工具和方法的合法性，以避免可能的法律风险。