闲置土地违约金的计算主要依据《闲置土地处置办法》及相关地方性法规，具体计算方式需结合土地出让合同约定及政府处置方式，通常分为两种情形：

1. 未动工开发满1年但未满2年的情形
   根据《闲置土地处置办法》第十四条，若土地使用权人未按合同约定动工开发满1年，政府将征收相当于土地使用权出让金20%以下的土地闲置费。违约金计算基数为土地出让金总额，具体比例由市、县国土资源主管部门根据闲置原因、土地价值等因素综合确定（例如：出让金1000万元，最高可征收200万元闲置费）。
   例外情形：若因政府原因导致闲置（如未按时交付土地、规划调整等），经核实后政府需与土地使用权人协商，通过延长开发期限、调整土地用途等方式处置，不征收闲置费。

2. 未动工开发满2年的情形
   根据《闲置土地处置办法》第十四条，政府有权无偿收回国有建设用地使用权，但需满足以下条件：

   • 已签订土地出让合同并缴纳出让金；
     
   • 土地闲置非因政府原因或不可抗力导致；
     
   • 政府已书面催告开发且土地使用权人未履行。
     特殊情形：若土地已投入一定开发成本（如完成地基工程），政府可能根据实际投入情况协商补偿，但土地使用权仍可能被收回。

补充说明：

• 合同约定优先：若土地出让合同中明确约定了闲置土地违约金条款（如按日计收违约金），且该条款不违反法律强制性规定，则以合同约定为准。
  
• 地方性差异：部分城市（如深圳、上海）可能出台更严格的闲置土地处置细则，例如提高闲置费征收比例或缩短收回期限，需结合当地政策执行。
  
• 救济途径：若对政府征收闲置费或收回土地的决定有异议，土地使用权人可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

建议：若您涉及闲置土地处置问题，需尽快核查土地出让合同条款、闲置原因及政府处置程序，必要时可提供具体材料进一步分析。