关于电动三轮车闯红灯罚款50元是否合理的问题，这主要取决于该电动三轮车在当地被认定的车辆属性，即是非机动车还是机动车。

首先，如果电动三轮车被认定为非机动车，那么根据《中华人民共和国道路交通安全法》第八十九条的规定，非机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的，处警告或者五元以上五十元以下罚款。因此，在这种情况下，电动三轮车闯红灯被罚款50元是符合法律规定的，是合理的。

其次，如果电动三轮车被认定为机动车，那么根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条以及《机动车驾驶证申领和使用规定》的相关规定，机动车驾驶人违反道路交通信号灯通行的，将面临警告或者二十元以上二百元以下罚款，并且驾驶证会被记6分。虽然这种情况下罚款的起点是20元，但具体罚款数额会根据当地交通法规和执法力度有所不同，50元的罚款也是在这个范围内可能的，因此同样可以认为是合理的，尤其是当考虑到闯红灯行为的严重性和对交通安全的潜在威胁时。

此外，还需要考虑地区差异和执法力度。不同地区对于三轮车的管理和执法可能存在差异，具体的处罚标准应以当地的交通法规和实际执法情况为准。有些地区可能对于电动三轮车的管理更为严格，罚款数额也可能相应较高。

最后，无论电动三轮车是否上牌，闯红灯都是违反交通法规的行为，应务必遵守交通规则。上牌的三轮车闯红灯将明确受到法律处罚，而未上牌的三轮车虽然可能因无法确定责任人而难以直接处罚，但闯红灯行为仍然违法，且存在极大的安全隐患。

综上所述，电动三轮车闯红灯罚款50元是否合理，主要取决于该车的车辆属性以及当地的交通法规和执法力度。但无论如何，遵守交通规则是每个驾驶人的责任和义务，为了自身和他人的安全，请务必严格遵守交通法规。