保证人在主债务人破产终结后代偿本金后，有权向反担保人追偿本金及违约金，但需满足一定条件。具体分析如下：

1. 保证人追偿权的法律基础
   根据《民法典》第700条，保证人承担保证责任后，除当事人另有约定外，有权在其承担保证责任的范围内向债务人追偿。若存在反担保合同，保证人作为反担保权人，可依据反担保合同向反担保人主张权利。反担保的担保范围通常包括主债权及利息、违约金、损害赔偿金等（参考《民法典》第389条），因此违约金条款若合法有效，应纳入追偿范围。

2. 主债务人破产终结的影响
   主债务人破产程序终结后，若保证人已实际代偿本金，其追偿权不因债务人破产而消灭。但需注意：

   • 若破产程序中保证人已申报债权并获得部分清偿，追偿时需扣除已受偿部分；
     
   • 若破产程序因无财产可供分配而终结，保证人仍可向反担保人全额追偿，但需证明反担保合同独立于主债务合同（如反担保合同明确约定不受主债务人破产影响）。

3. 违约金追偿的合法性
   反担保合同中约定的违约金需符合《民法典》第585条：

   • 违约金数额不得过分高于实际损失（通常以损失的30%为限）；
     
   • 若反担保人主张调整违约金，需承担举证责任。
     若违约金条款显失公平或违反强制性规定，可能被法院部分或全部驳回。

4. 实务操作建议

   • 证据固定：保留代偿凭证、反担保合同、违约金计算依据等书面材料；
     
   • 时效注意：追偿权诉讼时效为3年，自保证人实际承担保证责任之日起计算；
     
   • 合同审查：确认反担保合同是否明确约定“追偿范围包括违约金”，避免条款模糊导致争议。

结论：在反担保合同合法有效且违约金条款合理的前提下，保证人可向反担保人追偿本金及违约金。若遇反担保人抗辩（如主张调整违约金或否认合同效力），需结合具体证据和合同条款进一步分析。如有具体案情或合同文本，可进一步向我提供细节以便精准解答。