在个人劳务费以单位名义代开发票的情况下，起诉时的主体确定需分情况讨论：

1. 若个人与单位之间存在明确的劳务合同关系，且单位同意或实际以自身名义代开发票
   在这种情况下，尽管发票是以单位名义开具，但实际的劳务提供者是个人，劳务接受方（即付款方）与个人之间存在直接的劳务合同关系。因此，如果因劳务费支付等问题产生纠纷并提起诉讼，诉讼主体应为个人（原告）与劳务接受方（被告）。单位在此情况下可能作为第三人参与诉讼，尤其是当单位与案件处理结果有法律上的利害关系时，但这并非绝对，需根据具体案情判断。

2. 若个人与单位之间不存在劳务合同关系，单位仅是出于某种原因（如税务筹划、方便结算等）代个人开具发票
   此时，单位与个人之间可能构成委托关系或其他法律关系，但劳务合同关系仍然存在于个人与实际的劳务接受方之间。若因劳务费问题起诉，诉讼主体仍应为个人与实际的劳务接受方。单位若未直接参与劳务合同的履行，通常不作为诉讼的直接主体，除非其行为构成了对个人或劳务接受方权益的侵害，且该侵害与发票代开行为有直接关联。

3. 特殊情况：单位作为名义上的劳务接受方，但实际劳务由个人提供，且单位未向个人支付劳务费
   在这种情况下，如果单位以自身名义接受了发票但未将款项支付给个人，个人可以基于与单位之间的实际法律关系（可能是事实上的劳务合同关系或其他）向单位提起诉讼。此时，诉讼主体为个人（原告）与单位（被告）。但需注意，这种情况下需要充分证据证明个人与单位之间存在实际的法律关系，以及单位未履行支付义务的事实。

总结与建议：

• 在起诉前，务必明确个人与单位之间的法律关系，以及发票代开行为的具体背景和目的。
• 收集并整理相关证据，包括劳务合同、工作记录、发票、付款凭证等，以证明个人与劳务接受方之间的实际关系及单位在其中的角色。
• 根据具体案情和证据情况，确定合适的诉讼主体和诉讼策略。
• 如有需要，可寻求专业律师的帮助，以确保诉讼的顺利进行和权益的有效维护。

在处理此类案件时，每个细节都可能对诉讼结果产生重要影响，因此务必谨慎对待。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。