针对您提出的问题，即在车让人的斑马线上突然跑出行人后及时停车，但车停在了斑马线上是否会罚款，以下是我的详细解答：
一、一般情况分析
短暂且非故意的停车：
- 如果您是在为了避让突然跑出的行人而紧急停车，且停车时间短暂，并未继续行驶或妨碍其他车辆和行人的正常通行，那么根据一般的交通管理原则，这种行为可能不会被直接认定为违规，因此也不太可能面临罚款或扣分的处罚。
长时间或故意停车：
- 如果您停车时间较长，或者停车行为明显妨碍了其他车辆和行人的通行，那么这种行为就可能被视为违章停车。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，违章停车可能会面临二十元以上二百元以下的罚款，具体罚款金额会根据地区和具体情况有所不同。
二、特殊情境考虑
交通拥堵：
- 如果您停车是因为前方交通拥堵，且这种拥堵并非由您造成，那么您的停车行为可能不会被认定为违规。但是，如果因此导致交通堵塞进一步加剧或影响其他车辆和行人的正常通行，您仍可能面临一定的处罚。
交警指挥：
- 如果在停车时有交警在现场指挥，且您遵循了交警的指挥，那么您的停车行为通常不会被处罚。交警的指挥具有最高的法律效力，驾驶人应严格遵守。
三、具体处罚规定
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，会被处警告或者二十元以上二百元以下罚款。因此，对于在斑马线上违法停车的行为，除了可能的扣分外（具体扣分情况需根据当地交通管理规定和停车行为来判断），车主还可能面临罚款。
四、建议与总结
- 严格遵守交通规则：为了避免不必要的处罚和确保道路安全，建议您在行驶过程中严格遵守交通规则，尊重行人的优先通行权，避免在斑马线上随意停车。
- 合理判断行车措施：在遇到前方交通拥堵或其他特殊情况时，应合理判断并采取适当的行车措施，如减速慢行、寻找合法停车区域等，以避免不必要的处罚和确保行车安全。
- 了解当地交通管理政策：不同地区的交通管理政策可能有所不同，建议您关注当地的交通管理政策，了解具体的处罚规定和免责情形。
综上所述，停在斑马线上是否会被罚款扣分取决于多种因素，包括停车的时间、原因、是否妨碍交通以及是否有交警指挥等。为了确保自身和他人的交通安全，建议您严格遵守交通规则，避免在斑马线上停车。如果确实需要停车，请选择合法的停车区域，并确保不影响其他车辆和行人的正常通行。