在机动车与行人发生碰撞，且司机被认定为主要责任的情况下，赔偿问题需依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关法律法规，结合事故具体情况来综合分析。以下是对此问题的详细解答：
一、责任划分基础
首先，要明确的是，在机动车与行人的交通事故中，由于行人通常处于弱势地位，法律倾向于保护行人，因此机动车一方往往承担更多的责任。当司机被认定为主要责任时，意味着其过错行为在事故中起到了主要作用。
二、赔偿原则
全面赔偿原则：司机作为主要责任方，应承担对行人因事故造成的全部损失的赔偿责任。这包括但不限于医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费，以及因伤致残或死亡而产生的残疾赔偿金、死亡赔偿金、被扶养人生活费等。
过错相抵原则：如果行人在事故中也存在过错，如未走人行横道、闯红灯等，那么根据行人的过错程度，可以适当减轻司机的赔偿责任。但需要注意的是，由于司机是主要责任方，因此即使行人有过错，司机仍需承担大部分赔偿责任。
三、具体赔偿比例
在司机主要责任的情况下，赔偿比例通常较高，可能达到80%-90%。具体比例需根据事故的具体情况、双方的过错程度以及当地司法实践来确定。例如，如果司机存在严重超速、醉酒驾驶等违法行为，而行人只是轻微违反交通规则，那么司机的赔偿责任可能会更接近90%。
四、赔偿解决途径
协商：双方可以就赔偿问题进行协商，达成一致意见后签订赔偿协议。这种方式灵活快捷，但需要注意协议内容的合法性和有效性。
调解：如果协商不成，可以寻求交通管理部门或人民调解委员会的调解。调解员会根据事故情况和相关法律法规，提出合理的赔偿建议，促使双方达成和解。
诉讼：如果调解也不成，或者一方对调解结果不满意，那么可以通过诉讼来解决赔偿问题。法院会根据事故证据、双方陈述和法律规定，作出公正的判决。
五、建议
及时报警并保护现场：发生事故后，司机应立即报警并保护现场，以便交通管理部门进行勘查和责任认定。
收集证据：司机应尽可能收集与事故相关的证据，如现场照片、视频、证人证言等，以便在后续处理中证明自己的立场。
寻求法律帮助：由于赔偿问题涉及复杂的法律法规和司法实践，建议司机在处理过程中寻求专业法律帮助，以确保自己的权益得到充分保护。
综上所述，当机动车撞行人且司机被认定为主要责任时，司机应承担对行人因事故造成的全部损失的赔偿责任，具体比例需根据事故情况和双方过错程度来确定。在处理过程中，建议司机及时报警、收集证据并寻求法律帮助。