结论前置：亲子鉴定原则上不能强制进行，应遵循自愿原则。但在特定情况下，如提供必要证据且另一方无正当理由拒绝鉴定，法院可推定对其不利的事实成立。以下从不同角度为您详细分析：
一、亲子鉴定的基本原则
亲子鉴定因涉及身份关系，原则上应当以双方自愿为原则。这既是对个人人身权利和隐私的尊重，也是法律程序正当性的体现。《中华人民共和国民法典》第一千零七十三条明确规定了对亲子关系有异议且有正当理由时，可以向人民法院提起诉讼，请求确认或否认亲子关系，但并未规定可以强制进行亲子鉴定。
二、民事诉讼中的亲子鉴定
一般情况：在大多数民事案件中，如婚姻家庭纠纷等，亲子鉴定需要当事人自愿配合。法院不能强制一方进行亲子鉴定，因为这可能侵犯其合法权益。例如，在离婚案件中，如果一方对子女的亲子关系提出异议，但另一方不同意进行亲子鉴定，法院通常不会强制进行鉴定，而是会依据其他证据来综合判断亲子关系。
特殊情况下的推定：根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第三十九条，若父或母向人民法院起诉请求否认或确认亲子关系，并已提供必要证据予以证明，而另一方没有相反证据又拒绝做亲子鉴定的，人民法院可以认定否认或确认亲子关系一方的主张成立。这是一种基于证据规则的推定，而非强制鉴定。具体来说，包括两种情形：
三、刑事诉讼中的考虑
虽然您的问题主要涉及民事诉讼，但通常而言，刑事案件同样遵循合法、正当的程序。对于可能需要通过亲子鉴定确定事实的案件，如果犯罪嫌疑人或相关人员不配合，法院不能简单强制进行亲子鉴定，而应通过其他证据综合判断案件事实。不过，在极少数涉及重大公共利益、国家安全或为了查明某些严重犯罪事实等特殊情形下，并且有严格的法律程序和审批要求，可能会依法强制进行亲子鉴定，但这种情况非常罕见且严格受限。
四、侵犯合法权益的责任
强行进行亲子鉴定可能侵犯被鉴定人的隐私权、身体权等合法权益。被鉴定人有权拒绝任何非法的亲子鉴定要求。如果因强行进行亲子鉴定导致他人合法权益受损，相关责任人需承担法律责任，包括民事赔偿责任、行政责任甚至刑事责任。
五、建议
尊重意愿：在进行亲子鉴定前，应充分尊重被鉴定人的意愿和合法权益。如果对亲子关系有异议，应通过合法途径解决，如向人民法院提起诉讼并申请进行亲子鉴定。
提供证据：如果决定提起诉讼并申请亲子鉴定，应尽可能提供必要的证据来支持自己的主张。这有助于法院在另一方拒绝鉴定时，依据证据规则进行推定。
保护隐私：在整个过程中，应注意保护被鉴定人的隐私权和其他合法权益。避免将亲子鉴定结果泄露给无关人员或用于非法目的。
如果您在亲子关系案子中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律服务。