企业注销后发现行政违法责任，法律责任并不会因此消失，相关责任人和主体仍需根据违法行为的性质承担相应的行政责任，甚至可能涉及民事责任或刑事责任。以下从不同角度为您详细分析：
一、行政责任方面
调查与处罚的继续：
- 企业注销不影响行政机关对其存续期间的违法行为进行调查和处罚。行政机关可依法对原企业及相关责任人作出行政处罚决定，如罚款、吊销许可证等。
- 法律依据：虽然企业已注销，但行政机关仍可根据《中华人民共和国行政处罚法》等相关法律法规，对违法行为进行调查，并依据调查结果作出处罚决定。
责任追究对象：
- 即使企业已注销，行政机关仍可追究法定代表人、直接负责的主管人员和其他直接责任人员的行政责任。
- 特殊情况：若企业未经清算即办理注销登记，有限责任公司的股东、股份有限公司的董事和控股股东等可能需对公司债务（包括行政处罚债务）承担清偿责任。
持续性违法行为的责任：
- 如环境污染等持续性违法行为，即便企业注销，其后续责任仍由相关责任人员承担。
- 举例说明：若企业在注销前存在未处理的污染问题，注销后行政机关仍可追究原企业相关责任人员的法律责任，要求其承担治理费用或赔偿损失等。
二、民事责任方面
公司清算时已依法履行通知和公告义务：
- 若企业在注销前已按法定程序进行清算，并清偿了所有已知债务，则注销后发现的违法行为所产生的民事责任，通常由股东以其在公司剩余财产分配中所取得的财产为限承担清偿责任。
- 法律依据：依据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（二）》第十九条，有限责任公司的股东等在公司解散后恶意处置财产或提供虚假清算报告骗取注销登记，需对债务承担相应赔偿责任。
公司清算时未依法履行通知和公告义务：
- 若企业未按规定履行通知和公告义务，导致债权人未能及时申报债权，清算义务人（如股东、董事等）需对债权人承担赔偿责任。
- 法律依据：根据《公司法》相关规定，清算组需在规定时间内通知债权人并公告，未履行此义务将承担责任。
三、刑事责任方面
单位犯罪责任：
- 若企业违法行为构成犯罪，即使注销，司法机关仍会追究相关责任人的刑事责任。单位犯罪时，除对单位判处罚金外，还会对直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚。
- 举例说明：若企业在注销前存在偷税漏税等犯罪行为，注销后司法机关仍可追究原企业相关责任人员的刑事责任，如判处有期徒刑、罚金等。
证据收集与追溯：
- 尽管企业注销可能增加证据收集和调查的难度，但司法机关可通过调取工商登记档案、财务账目等方式，尽可能还原案件事实，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
综合建议
为避免注销后发现违法行为所带来的法律风险，企业和相关人员应在运营期间严格遵守法律法规，建立健全的合规体系。一旦发现违法行为，应立即采取措施整改，并主动向相关部门报告，以减轻可能的法律责任。同时，对于注销过程中的清算工作，也应严格按照法律规定进行，确保通知和公告义务的履行，以避免后续的民事纠纷和法律风险。
企业在注销后若发现存在行政违法行为，相关责任人和主体仍需根据违法行为的性质承担相应的法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。