有限责任公司自然人独资没有对公账户，这一行为本身并不直接构成违法，但可能引发一系列法律和实务上的问题，从合规和风险防控的角度，建议设立对公账户。以下从不同角度进行分析：
法律层面分析：
- 公司法规定：根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，公司应当依法设立银行账户，用于公司的资金往来和财务管理。虽然法律并未明确规定自然人独资的有限责任公司必须设立对公账户，但设立对公账户是公司规范运营、保障交易安全、便于税务管理的重要措施。
- 税务管理要求：税务机关通常要求公司使用对公账户进行税务申报和缴纳税款，以确保税收的准确性和及时性。如果公司没有对公账户，可能会给税务管理带来不便，甚至引发税务风险。
实务操作角度：
- 交易安全：使用对公账户进行资金往来，可以增强交易双方的信任度，保障交易的安全。如果公司使用个人账户进行资金往来，可能会让交易对方产生疑虑，影响公司的商业信誉。
- 财务管理：对公账户有助于公司建立规范的财务管理制度，便于对资金流动进行监控和管理。如果公司没有对公账户，可能会导致财务管理混乱，增加内部腐败和资金流失的风险。
- 法律责任：如果公司使用个人账户进行资金往来，且该个人账户与公司业务存在混同，那么在公司面临法律纠纷时，可能会被视为公司财产与个人财产混同，从而承担连带责任。
风险防控建议：
- 设立对公账户：为了降低法律风险和实务操作上的不便，建议自然人独资的有限责任公司设立对公账户，并规范使用。
- 完善财务管理制度：公司应建立完善的财务管理制度，确保资金流动的透明度和合规性。
- 避免个人账户与公司业务混同：公司应严格区分个人账户和对公账户的使用，避免个人账户与公司业务产生混同，以降低法律责任风险。
总结来说，虽然有限责任公司自然人独资没有对公账户并不直接违法，但出于合规和风险防控的考虑，建议设立对公账户并规范使用。如果公司确实存在特殊情况无法设立对公账户，也应通过其他方式确保资金流动的透明度和合规性，并咨询专业律师以降低法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。