工厂自离扣500元是否合理，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：

一、不合法的情况

1. 无明确规章制度或规章制度未公示：

   • 若工厂未通过民主程序制定并向员工公示的规章制度，或规章制度中未明确规定自离情形及罚款额度，则扣500元缺乏制度支撑，属于不合法行为。

2. 规章制度内容违法：

   • 即便工厂有罚款制度，但若该制度内容违反法律法规，如罚款后导致员工工资低于当地最低工资标准，则此罚款行为同样不合法。

3. 缺乏事实依据：

   • 若工厂无法提供确凿证据证明员工存在自离行为，或自离行为给工厂造成了实际损失，仅凭主观判断进行罚款，则此行为缺乏事实依据，属于不合法罚款。

4. 违反《劳动法》规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。因此，若无正当理由，工厂不得随意罚款。另外，根据《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。这意味着，即便是因为劳动者原因造成的损失需要赔偿，也有严格的限制条件，超出规定范围的罚款也是不合法的。

二、合法的情况（但需严格符合条件）

1. 符合法律规定及规章制度：

   • 工厂需依法制定完善且合理的规章制度，并经过民主程序向员工公示。规章制度中应明确规定自离情形对应的罚款情形和额度，且该额度需符合法律法规的限制。

2. 有明确的事实依据：

   • 工厂需有充分证据证明员工确实实施了自离行为，且该行为给工厂造成了实际损失，如因自离导致的生产延误、客户流失等。

3. 遵守赔偿规定：

   • 如上述《工资支付暂行规定（1994年版）》第十六条所述，在符合规定的条件下进行赔偿扣除。即，若员工自离给工厂造成损失，工厂可要求员工赔偿，但赔偿金额需符合法律法规的限制，如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20％，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。

三、维权途径

若员工认为工厂扣500元不合法，可通过以下途径维护自身权益：

1. 与工厂沟通协商：

   • 首先尝试与工厂进行沟通，要求其说明罚款依据，并出示相关规章制度和证据。

2. 向劳动监察部门投诉：

   • 若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉举报，请求劳动监察部门介入调查并处理。

3. 申请劳动仲裁：

   • 若投诉未能解决问题，员工可依法向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，请求仲裁委员会裁决工厂返还非法扣除的工资。

4. 提起劳动诉讼：

   • 若仲裁结果仍不满意，员工可依法向人民法院提起劳动诉讼，通过司法途径维护自身合法权益。

总结：工厂自离扣500元是否合理，需根据工厂的规章制度、事实依据以及法律法规进行综合判断。若工厂无法提供合法依据或违反了相关法律法规，则该罚款行为不合法。员工在面对不合法罚款时，应充分了解相关法律法规，并采取适当措施维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。