核心结论：赔偿问题需结合具体法律关系、合同约定及过错程度综合判断，可能涉及以下几种情况：

1. 若双方为买卖合同关系
   若5万元货款对应的是买卖合同中的标的物，而该标的物因质量问题导致第三方100万元损失，赔偿需分两步分析：

   • 合同相对性原则：买方通常只能向卖方主张违约责任（如退货、换货、修理或赔偿直接损失），但赔偿范围一般不超过合同履行后可预期的利益（即5万元货款对应的价值）。
     
   • 例外情形：若卖方明知标的物存在缺陷仍故意隐瞒，或标的物缺陷导致人身伤害、其他财产损失（如买方因货物问题被第三方索赔），可能突破合同相对性，需根据《民法典》第1202条（产品责任）承担侵权责任，赔偿范围可能扩大至100万元实际损失。但需买方举证卖方存在过错（如故意或重大过失）。

2. 若双方为委托加工/保管等合同关系
   若5万元是委托方支付的费用，而受托方因保管不善或操作失误导致委托物或第三方财产损失100万元：

   • 有偿委托：受托方需按过错程度赔偿实际损失，但若合同明确约定了赔偿限额（如“最高赔偿不超过委托费用”），则可能以5万元为限。
     
   • 无偿委托：受托方仅在故意或重大过失时承担赔偿责任，且赔偿范围通常以实际损失为限（100万元），但需委托方举证受托方存在重大过错。

3. 若涉及侵权责任（如货物运输中损坏第三方财产）
   若5万元货款对应的货物在运输过程中因承运人过错导致第三方100万元损失：

   • 承运人需根据《民法典》第832条承担侵权责任，赔偿范围为实际损失（100万元），但若承运人能证明自身无过错（如不可抗力、货物自然性质等），可免责或减责。
     
   • 若托运人（卖方）对损失存在过错（如包装不当），可能需与承运人按过错比例分担赔偿。

关键建议：

• 固定证据：立即保存合同、付款记录、损失证明（如第三方索赔函、评估报告）、沟通记录等，以明确法律关系及过错方。
  
• 协商优先：尝试与对方协商赔偿方案（如分期赔偿、以货抵债），降低诉讼成本。
  
• 诉讼风险：若协商无果，需评估诉讼成本（时间、费用）与赔偿金额的性价比，100万元赔偿可能涉及高额诉讼费及执行风险。
  

提示：具体赔偿金额需结合合同条款、过错程度、损失因果关系等综合判断，建议提供更多细节（如合同类型、损坏原因、损失主体等），以便进一步分析。