涉及不动产抵押的借款合同纠纷是可以约定管辖的，但需满足一定条件。以下是对这一问题的详细分析：

一、约定管辖的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条的规定，合同或者其他财产权益纠纷的当事人可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与争议有实际联系的地点的人民法院管辖，但不得违反本法对级别管辖和专属管辖的规定。这一条款为借款合同纠纷中的约定管辖提供了明确的法律依据。

二、约定管辖的有效性条件

1. 书面形式：管辖协议必须采用书面形式，口头约定无效。
2. 与争议有实际联系：约定的管辖法院必须与争议有实际联系，如被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等。
3. 不违反级别管辖和专属管辖：约定的管辖法院不得违反法律的级别管辖和专属管辖规定。例如，不能将应由中级人民法院管辖的案件约定由基层法院管辖；对于涉及不动产等特殊情形的借款合同纠纷，应遵循专属管辖的规定。

三、不动产抵押借款合同纠纷的专属管辖

虽然不动产抵押合同属于借款合同的从合同，但在涉及不动产物权的确认、分割、相邻关系等引起的物权纠纷，以及抵押物的处置、优先受偿权等与不动产权利直接相关的纠纷时，可能会参照不动产专属管辖的原则处理。这意味着，如果纠纷主要围绕不动产本身展开，如抵押权的设立、效力、实现等，那么可能由不动产所在地的人民法院专属管辖，此时双方约定的管辖法院可能无效。

四、实践应用与建议

1. 明确约定管辖法院：在签订不动产抵押借款合同时，双方应明确约定管辖法院，并确保该约定符合法律规定。这有助于在发生纠纷时，双方能够更清楚地知道应向哪个法院提起诉讼，提高纠纷解决的效率。
2. 注意专属管辖的例外：如果纠纷主要围绕不动产本身展开，如涉及抵押物的处置、优先受偿权等，那么应特别注意专属管辖的规定，避免因约定管辖法院而无效。
3. 咨询专业律师：在约定管辖法院时，建议咨询专业律师，以确保约定的合法性和有效性。律师可以根据具体情况，为双方提供专业的法律建议和指导。

五、示例说明

假设甲向乙借款，并以一套房产作为抵押签订了不动产抵押借款合同。在合同中，双方可以约定若因该合同发生争议，由乙所在地的人民法院管辖（假设乙所在地与争议有实际联系，且不违反级别管辖和专属管辖的规定）。然而，如果纠纷主要围绕抵押房产的处置、优先受偿权等展开，那么可能由抵押房产所在地的人民法院专属管辖，此时双方约定的管辖法院可能无效。

综上所述，涉及不动产抵押的借款合同纠纷是可以约定管辖的，但需满足一定条件。在签订合同时，双方应明确约定管辖法院，并注意专属管辖的例外情况。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。