结论：男方不让女方住的行为一般是不合法的，因为离婚协议中已明确约定房子归女方所有。
法律分析：
离婚协议的效力：
- 离婚协议是双方自愿达成的，关于财产分割、子女抚养等问题的约定，具有法律约束力。一旦双方在离婚协议上签字并办理了离婚登记，该协议即生效，双方应按照协议履行各自的义务。
- 在您的情况下，离婚协议中明确约定房子归女方所有，这是双方真实意思的表示，且不违反法律法规的强制性规定，因此该约定是有效的。
男方的行为性质：
- 男方不让女方住的行为，实际上是对离婚协议中关于房产分割约定的违反。女方作为房产的合法所有者，有权享有该房产的占有、使用、收益和处分的权利。
- 男方的行为可能构成对女方物权的侵害，女方有权要求男方停止侵害、排除妨碍，并可以依法向人民法院提起诉讼，要求确认房产归属并保护自己的居住权。
可能的法律后果：
- 如果女方选择通过法律途径解决，人民法院在审理此类案件时，会首先审查离婚协议的合法性和有效性。一旦确认离婚协议有效，且房产确实归女方所有，人民法院会判决男方停止侵害女方的居住权，并可能要求男方承担一定的民事责任，如赔偿女方因无法居住而产生的额外费用等。
- 在极端情况下，如果男方的行为构成犯罪（如非法侵入住宅罪等），女方还可以向公安机关报案，要求追究男方的刑事责任。不过，这种情况相对较少见，且需要满足一定的构成要件。
建议：
- 女方可以先与男方进行协商，尝试通过友好沟通解决问题。如果协商无果，女方可以收集相关证据（如离婚协议、房产证、男方不让居住的证据等），并向人民法院提起诉讼，要求确认房产归属并保护自己的居住权。
- 在诉讼过程中，女方应注意保护自己的合法权益，避免与男方发生不必要的冲突和纠纷。同时，女方也可以咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的权益。
额外提醒：
- 离婚协议中的财产分割约定是双方自愿达成的，一旦生效即具有法律约束力。因此，在签订离婚协议时，双方应充分考虑各种因素，确保协议的公平性和合理性。
- 如果双方对离婚协议中的某些条款存在争议或疑问，应及时咨询专业律师的意见，以便在签订协议前明确各自的权利和义务。
希望以上分析能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。