店员职务侵占罪的立案标准为三万元及以上。这是根据2023年修订的《关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（二）》所明确规定的，也是当前司法实践中应当遵循的标准。以下是对这一问题的详细分析：

一、立案标准的具体数额

1. 一般标准：

   • 根据上述规定，店员利用职务便利非法侵占本单位财物达三万元及以上的，公安机关应当予以立案追究其刑事责任。这一标准是明确的，且应严格遵守。

2. 数额较大的认定：

   • 职务侵占罪中的“数额较大”起点通常为六万元（部分地区可能根据经济发展水平有所调整，但三万元是基本立案标准）。即，侵占数额在六万元以上的，认定为职务侵占罪中的“数额较大”，应立案追诉。不过，从立案追诉的角度，三万元即已达到标准。

3. 地区差异：

   • 虽然法律规定了明确的立案标准，但不同地区可能会根据当地的经济情况、社会状况等因素，在司法实践中对立案标准有一定的灵活处理。然而，这种灵活处理并不意味着可以随意改变法律规定的立案标准，而是在严格遵循法律规定的基础上，结合具体情况进行适当考量。但无论如何，三万元是基本的立案门槛。

二、职务侵占罪与盗窃罪的区分

• 行为主体：职务侵占罪要求主体具有特定身份，即公司、企业或其他单位的工作人员，并利用职务便利；盗窃罪的主体为一般主体，无特定身份要求。
• 行为方式：职务侵占罪是利用职务之便非法占有本单位财物；盗窃罪是以秘密窃取的方式获取公私财物。
• 立案标准：职务侵占罪的立案标准相对较高，为三万元及以上；盗窃罪的立案标准则因地区而异，通常为一千元至三千元以上。

三、法律建议与措施

1. 保存证据：

   • 一旦发现店员有职务侵占行为，公司或受害方应立即保存好相关证据，包括但不限于侵占行为的记录、财务账目、监控录像等。这些证据将有助于后续的法律程序。

2. 及时咨询与报案：

   • 应及时向我这样的专业律师咨询，以便更好地了解自己的权益和可能的法律途径。如果符合立案标准，应坚决向公安机关报案，追究侵占者的刑事责任。

3. 加强内部管理：

   • 公司应加强内部财务管理和监督机制，完善财务制度，确保财物的安全管理。同时，定期对员工进行法律知识培训和教育，提高员工的法律意识，明确告知侵占财物的严重后果和法律责任。

四、可能的法律后果

• 如果店员被认定构成职务侵占罪，且数额较大，将面临三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金的刑罚。如果数额巨大或者有其他严重情节，刑罚将更为严厉。

综上所述，店员职务侵占罪的立案标准为三万元及以上。在实际操作中，我们应注意保存证据、及时咨询法律人士并依法报案，以有效维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。