针对您提出的“两车牌号一样怎么处罚”的问题，这实际上涉及到的是套牌或使用其他车辆号牌的违法行为。以下是我为您详细解答的处罚情况及相关法律依据：
一、处罚情况
罚款：根据相关法律法规，使用其他车辆号牌的违法行为，一旦被查获，将面临高额的罚款。具体罚款数额可能因地区和具体情节而有所不同，但通常都在数千元以上，如有的案例中被处以5000元的罚款。
记分：除了罚款外，驾驶人的驾驶证还会被记分。在多数情况下，此类违法行为会被记满12分，这意味着驾驶人的驾驶证将被暂扣，需要重新参加科目一考试并合格后才能恢复驾驶资格。
扣留车辆：警方在查获套牌车辆后，会依法扣留车辆，并进行进一步的调查处理。如果车辆存在其他违法行为或安全隐患，还可能面临更严厉的处罚。
二、法律依据
此类违法行为主要违反了《中华人民共和国道路交通安全法》中关于车辆号牌使用的相关规定。具体来说，任何单位或者个人不得使用其他机动车的号牌，也不得伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车号牌。违反这些规定的，将受到法律的严惩。
三、实际案例
以您提供的案例为例，永川一男子因克隆自己另一辆车的牌号被警方查获，最终被处以罚款5000元、记12分的处罚，并且套牌车辆被依法扣留。这一案例充分说明了警方对此类违法行为的“零容忍”态度，以及违法者将面临的严重后果。
四、建议
为了避免此类违法行为的发生，我建议您：
遵守法律法规：严格遵守《中华人民共和国道路交通安全法》中关于车辆号牌使用的相关规定，不使用其他车辆的号牌，也不伪造、变造或使用伪造、变造的号牌。
及时办理相关手续：如果您的车辆需要上户或补办号牌，请及时到车管所办理相关手续，确保车辆的合法上路。
提高警惕：在驾驶过程中，如果发现有其他车辆使用与您的车辆相同的号牌，请及时向警方报警，共同维护良好的交通秩序。
综上所述，两车牌号一样属于严重的违法行为，将面临罚款、记分和扣留车辆等处罚。希望您能够严格遵守法律法规，共同维护良好的交通环境。