结论：将两部分单独注册的商标合在一起使用是否合法，需分情况讨论，关键在于是否会导致公众混淆误认、是否侵犯他人在先权利，以及是否符合商标使用的规范要求。

1. 若两部分商标均属于同一权利人，且组合使用不会导致公众混淆误认
   若两部分商标均由同一主体注册，且组合后的标识与单独使用时在整体视觉效果、含义、呼叫等方面无显著差异，或组合后仍能清晰区分原商标的独立来源，通常可以合法使用。但需注意：

   • 商标使用规范：需确保组合使用的方式符合商标注册时的核定范围（如颜色、字体、排列方式等）。若组合方式与注册证上的样式差异较大，可能被认定为未规范使用商标，存在被撤销或侵权的风险。
     
   • 显著性要求：组合后的标识需保持整体显著性，避免因过度简化或变形导致丧失区分商品来源的功能。
     

2. 若两部分商标属于不同权利人，或组合使用可能导致公众混淆误认

   • 侵权风险：若两部分商标分别属于不同主体，且组合后的标识与某一权利人的商标构成近似（如文字、图形、颜色组合等核心要素相同或近似），可能被认定为侵犯他人商标专用权。例如，A公司注册“苹果”文字商标，B公司注册“图形苹果”商标，若将两者组合使用，可能因整体近似而侵权。
     
   • 不正当竞争：即使组合后的标识不直接侵犯商标权，若通过模仿他人商标的独特设计或风格，误导公众认为与他人存在特定联系（如关联企业、授权关系），可能构成不正当竞争行为。
     

3. 特殊情形：组合使用构成新商标
   若两部分商标组合后形成了全新的、具有独立显著性的标识，且该组合未被他人注册，理论上可以申请注册为新商标后使用。但需注意：

   • 在先权利冲突：需确保组合后的标识不侵犯他人在先的著作权、外观设计专利权等权利。
     
   • 显著性审查：商标局可能对组合后的标识进行显著性审查，若缺乏显著性（如仅由通用名称、描述性词汇组成），可能被驳回注册申请。
     

建议：

• 权利人一致时：优先检查商标注册证上的核定使用范围，确保组合使用方式符合规范；若需变更样式，可考虑申请商标变更或重新注册。
  
• 权利人不一致时：避免直接组合使用他人商标，可通过授权许可、联合品牌合作等方式合法使用；若需独立使用组合标识，建议提前进行商标检索和侵权风险评估。
  
• 不确定时：可委托专业机构进行商标相似性检索和法律分析，降低使用风险。
  

如有具体商标案例或使用场景，可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供更详细的法律意见。