结论：甲方代表收取乙方房屋买卖佣金提成是否合法，需根据具体情况判断，主要包括是否具备合法资质、是否符合合同约定以及是否违反法律法规的强制性规定。以下从不同角度详细分析：

1. 资质与身份角度

   • 合法资质要求：根据《中华人民共和国房地产管理法》及相关规定，从事房地产经纪业务（包括房屋买卖佣金收取）的主体需具备相应的合法资质，通常是依法设立并取得营业执照的房地产经纪机构。若甲方代表个人不具备房地产经纪资质，却以个人名义收取佣金提成，则可能涉嫌违法经营，该行为不合法。
   • 身份界定：若甲方代表是房地产经纪机构的员工，且其收取佣金的行为是在执行职务过程中，且该机构具备合法资质，同时佣金收取符合行业规范及合同约定，则该行为可能是合法的。但若甲方代表并非经纪机构员工，或虽为员工但超出职务范围私自收取佣金，则可能构成违法。

2. 合同约定角度

   • 合同内容审查：房屋买卖合同中应明确约定佣金的支付方式、支付对象及支付条件。若合同中明确约定佣金应支付给具备合法资质的房地产经纪机构，而非甲方代表个人，则甲方代表收取佣金提成可能违反合同约定，不合法。
   • 双方合意：若合同中虽未明确约定佣金支付对象，但双方在实际履行过程中通过补充协议、口头约定或其他方式达成一致，同意由甲方代表收取佣金提成，且该约定不违反法律法规的强制性规定，则该行为可能是合法的。但需注意，口头约定在发生纠纷时可能难以证明，建议尽量采用书面形式。

3. 法律法规强制性规定角度

   • 禁止性规定：根据相关法律法规，房地产经纪业务不得由无资质的个人或机构从事，且佣金收取需遵循行业规范及公平、自愿、诚实信用的原则。若甲方代表收取佣金提成违反了这些禁止性规定，如通过欺诈、胁迫等手段迫使乙方支付佣金，或佣金标准明显高于行业平均水平且无正当理由，则该行为不合法。
   • 税务合规：甲方代表收取佣金提成还需考虑税务合规问题。若未依法申报纳税，则可能面临税务处罚，进一步影响该行为的合法性。

建议：

• 对于乙方而言，在签订房屋买卖合同时，应仔细审查合同条款，明确佣金支付方式、支付对象及支付条件，避免模糊表述。
• 若甲方代表提出收取佣金提成的要求，乙方应要求其出示合法资质证明，并核实其身份及授权范围。
• 在交易过程中，乙方应保留好相关证据，如合同、支付凭证、沟通记录等，以备不时之需。
• 若发生纠纷，乙方可及时咨询专业律师，通过法律途径维护自身合法权益。

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