针对您提出的“虚开发票交增值税了怎么处理”的问题，这是一个涉及税务法律责任的复杂问题，需要我们从多个角度进行详细分析。
一、法律责任层面
行政责任：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》的相关规定，虚开发票是明确的违法行为。税务机关将依法对虚开发票的行为进行行政处罚，这包括没收违法所得，并根据虚开金额的大小处以不同额度的罚款。具体来说，虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款。
刑事责任：
- 若虚开发票行为构成犯罪，将依据《中华人民共和国刑法》的相关规定进行严厉的刑事处罚。这包括有期徒刑、拘役、管制以及罚金等，具体刑罚根据虚开税款数额的大小和情节的严重程度来判定。对于单位犯罪，还会对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员依法处罚。
二、税务处理层面
纳税申报与调整：
- 如果您已经基于虚开的发票进行了增值税的申报和缴纳，那么在发现虚开后，应立即进行纳税申报的调整。这包括调增应纳税所得额，补缴因虚开发票而少缴的企业所得税，并可能需要加收滞纳金。
重新取得合法发票：
- 如果可能，您应尽快与开票方沟通，尝试重新取得合法有效的发票。如果能够重新取得，并提供相关证明，那么您之前基于虚开发票的进项税额可能得以抵扣，相应成本费用也可在企业所得税前扣除。
无法重新取得合法发票的处理：
- 如果无法重新取得合法发票，那么相关支出不得在发生年度税前扣除。您需要调增该年度应纳税所得额，并补缴企业所得税。但请注意，在这种情况下，通常不会加收滞纳金（除非存在其他偷税行为）。
三、企业应对措施与建议
加强内部管理：
- 企业应建立严格的发票管理制度，明确发票的开具、审核、保管等流程，确保发票管理的规范性和合法性。
定期自查与整改：
- 定期开展发票使用情况的自查工作，及时发现并整改问题。这有助于降低因虚开发票而引发的法律风险和经济损失。
提高员工合规意识：
- 通过组织培训、学习等方式，提高员工对发票管理相关法律法规的认识和理解，增强员工的合规意识和法律意识。
积极配合税务机关调查：
- 在面临税务机关检查或调查时，企业应积极配合，如实提供相关资料和信息，不得隐瞒、拒绝或阻挠。
综上所述，虚开发票交增值税是一种严重的违法行为，可能面临行政处罚和刑事处罚。因此，我强烈建议您严格遵守税收法律法规，加强内部管理，防范法律风险。如果已经发生了虚开发票的情况，应立即采取措施进行整改和补救，以降低潜在的法律风险和经济损失。同时，对于不确定的情况或需要进一步的法律指导，建议及时咨询专业的律师或税务机构。