结论：一般情况下，对方醉驾追尾您的车，交警不应扣您的车；若您的车被扣，可能是因调查取证等特殊需要，您可要求交警说明理由，对扣车有异议可申请行政复议或提起行政诉讼。以下为详细分析：
- 正常情况下不应扣您的车
- 在交通事故中，交警扣车的目的是为了进行检验、鉴定，以确定事故责任等关键信息。而在这起对方醉驾追尾您车的事故中，责任通常比较明确，对方醉驾本身就属于严重违反交通法规的行为，在事故中大概率要承担主要甚至全部责任。所以从常规的调查流程和责任认定角度来看，没有合理理由扣押您的车辆。
- 可能扣您车的情况及应对
- 调查取证需要：如果交警认为您的车辆存在某些与事故调查相关的特殊情况，例如怀疑您的车辆存在故障，且该故障可能与事故的发生有一定关联，需要对车辆进行详细检验鉴定，那么可能会暂时扣留您的车辆。在这种情况下，交警应当向您出具扣车的相关法律文书，并明确告知您扣车的原因和期限。您有权要求交警说明扣车的具体理由和依据。
- 对扣车有异议的处理：如果您认为交警扣车的行为不合理，或者扣车期限过长，您可以采取以下措施。首先，您可以向作出扣车决定的交警部门提出书面申请，要求解除扣车措施，并说明您的理由和依据。如果交警部门不予理会或者您对处理结果不满意，您可以在知道该具体行政行为之日起60日内向上一级公安机关交通管理部门或者同级人民政府申请行政复议；也可以在知道该具体行政行为之日起6个月内直接向人民法院提起行政诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
在处理此类问题时，您要保留好与事故相关的所有证据，如现场照片、视频、交警出具的相关文书等，以便在需要时维护自己的权益。如果您还有其他疑问，欢迎直接向我咨询。