公司停薪留岗（这里我们主要讨论的是非工伤情况下的停薪留职，因为工伤停工留薪有明确的法规规定）是一个涉及员工权益和公司管理的重要决策，需要注意以下几个方面以确保合法合规并维护双方权益：
一、协议签订与员工申请
要求员工出具停薪留职申请书：员工应提交书面申请，明确表达停薪留职的意愿，并签字盖手印确认。这份申请书应作为停薪留职协议的附件，由公司保留存档。
停薪留职协议内容：协议中应详细列出员工的具体信息（如姓名、身份证号、职位等）、停薪留职的开始和截止日期、员工的联系方式和送达地址等关键信息。这些信息有助于公司在需要时与员工取得联系，并确保协议的合法性和有效性。
二、双方权利与义务
工资与福利：协议中应明确约定在停薪留职期间，员工的工资是否发放、公司的相关福利（如年终奖、节日福利等）是否享受。如果工资不发放，应明确说明原因和依据；如果福利不享受，也应提前告知员工。
社保费用承担：双方应协商确定社保费用的承担方式。一般来说，公司可能会要求员工自行承担部分或全部社保费用，但这也需要根据当地法规和公司政策来具体确定。
工龄累计：协议中应明确停薪留职期间员工的工龄是否累计。这对于员工未来的晋升、退休等都有重要影响。
三、劳动关系处理
期满后的劳动关系：协议中应约定停薪留职期满后劳动关系的处理方式。如果双方希望继续履行劳动合同，可以提前约定工作岗位和待遇；如果员工不再返岗，应明确告知其需及时到公司办理离职手续。
返岗通知与旷工处理：协议中可以注明员工返岗前应提前告知公司，以便公司做好工作安排。如果员工未在规定时间内返岗，且未提前告知公司，公司可以依据规章制度视为旷工，并采取相应的处理措施。
四、联系方式与沟通
确保联系方式畅通：公司应要求员工留下随时能够联系到的联系方式，以便在需要时能够及时与员工取得联系。这有助于减少因沟通不畅而产生的误解和纠纷。
定期沟通与反馈：在停薪留职期间，公司可以定期与员工进行沟通，了解其生活和工作情况，提供必要的帮助和支持。这有助于增强员工对公司的归属感和忠诚度。
五、合规性与法律风险
遵守当地法规：公司在制定停薪留职政策时，应充分考虑当地法规的要求，确保政策的合法性和合规性。避免因违反法规而产生的法律风险和纠纷。
咨询专业法律意见：如果公司对停薪留职政策存在疑问或不确定的地方，可以咨询专业的法律意见，以确保政策的制定和实施符合法律法规的要求。
综上所述，公司停薪留岗需要注意协议签订与员工申请、双方权利与义务、劳动关系处理、联系方式与沟通以及合规性与法律风险等方面。通过制定合法合规的停薪留职政策，并加强与员工的沟通和反馈，可以确保双方权益得到保障，并维护公司的稳定和发展。