关于收取虚开增值税发票并抵扣进项税额的处罚，这确实是一个涉及严重法律后果的问题。以下是根据《中华人民共和国刑法》及相关司法解释，对此问题的详细解答：
一、核心法律依据
主要依据《中华人民共和国刑法》第二百零五条，该条款明确规定了对虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的行为进行处罚。这是处理此类案件的核心法律基础。
二、具体处罚规定
一般情节：
- 对于虚开增值税发票并抵扣进项税额，若情节一般，将处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金。
数额较大或有其他严重情节：
- 若虚开的税款数额较大（如五十万元以上），或者有其他严重情节（如因虚开导致国家税款被骗取达到一定金额等），将处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
数额巨大或有其他特别严重情节：
- 当虚开的税款数额达到巨大标准（如五百万元以上），或者有其他特别严重情节（如因虚开导致国家税款被骗取数额特别巨大等），将面临十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。
三、单位犯罪的处理
- 对于单位犯此罪的，将对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员按照个人犯罪的相应情节进行处罚。这意味着，不仅单位会受到经济处罚，相关责任人员也将面临刑事责任。
四、相关司法解释与量刑细化
- 根据最高人民法院、最高人民检察院的相关司法解释，对虚开税款数额的具体标准进行了明确，如虚开税款数额在十万元以上的应当依法定罪处罚，五十万元以上不满五百万元的认定为“数额较大”，五百万元以上的认定为“数额巨大”。
- 同时，司法解释还明确了“其他严重情节”和“其他特别严重情节”的具体情形，如无法追回的税款数额达到一定金额、五年内因虚开发票受过刑事处罚或二次以上行政处罚又虚开的等。
五、特殊情形的考量
- 并非所有与虚开增值税发票相关的行为都会构成犯罪。例如，若行为人没有骗取国家税款的意图，且未造成国家税款损失（如为虚增业绩、融资等目的而虚开但未抵扣税款），可能不构成犯罪。
- 有真实交易但代开或介绍代开增值税发票，若未造成国家税款损失，也可能不被认定为犯罪。但这种情况需要严格根据具体事实和法律规定来判断。
六、总结与建议
- 虚开增值税发票并抵扣进项税额是严重的经济犯罪行为，对个人和企业都有极大的法律风险和经济损失。因此，强烈建议企业和个人严格遵守税法规定，合法合规地开具和使用增值税发票。
- 加强内部财务管理和审计，防止虚开行为的发生。一旦发现相关问题或疑虑，应及时咨询专业律师以获取准确的法律意见和帮助。
希望以上解答能够为您提供清晰、详细、有深度的信息。如有任何进一步的问题或疑虑，请随时咨询。