公司向银行借款由部分股东来偿还的约定，在符合法律规定和公司章程的前提下，通常是有效的。以下从不同角度进行详细分析：
一、合同相对性原则
从合同法的角度来看，公司向银行借款，银行是债权人，公司是债务人。如果公司内部约定由部分股东来偿还这笔借款，这实际上是在公司内部形成了一个新的债权债务关系。这个约定并不改变公司与银行之间的原始债权债务关系，但它在公司内部股东之间产生了约束力。只要这个约定是股东之间真实意思的表示，且不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么这个约定就是有效的。
二、公司章程与股东协议
公司章程：公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的组织结构、运营方式、股东权利与义务等基本事项。如果公司章程中明确规定了股东在特定情况下需要承担公司债务的责任，那么部分股东偿还公司借款的约定就是符合公司章程的，因此也是有效的。
股东协议：股东之间可以签订协议，就公司的经营管理、利润分配、债务承担等事项进行约定。如果股东协议中明确规定了由部分股东来偿还公司借款，且这个协议没有违反法律、行政法规的强制性规定，也没有损害公司、其他股东或债权人的利益，那么这个约定就是有效的。
三、法律限制与例外
虽然部分股东偿还公司借款的约定在一般情况下是有效的，但也存在一些法律限制和例外情况：
股东有限责任原则：根据《公司法》的规定，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。这意味着，在正常情况下，股东不需要承担公司债务的无限责任。如果部分股东偿还公司借款的约定违反了这一原则，且没有合理的理由（如股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务等），那么这个约定可能会被认定为无效。
债权人同意：如果公司借款时，银行或其他债权人明确要求公司股东承担连带责任或特定股东承担还款责任，并且这种要求被写入借款合同中，那么部分股东偿还公司借款的约定就需要得到债权人的同意。否则，这个约定可能无法对抗债权人，债权人仍然有权要求公司或所有股东承担还款责任。
四、实际案例与操作建议
在实际操作中，部分股东偿还公司借款的约定通常出现在公司重组、债务重组或股东之间内部调整等场景中。为了确保约定的有效性，建议采取以下措施：
签订书面协议：股东之间应该签订书面协议，明确约定由部分股东偿还公司借款的具体事项，包括还款金额、还款期限、违约责任等。
获得债权人同意：如果可能的话，应该尽量获得银行或其他债权人的同意，并将这种同意写入借款合同或相关协议中。
遵守公司章程和法律规定：在制定和执行约定时，应该严格遵守公司章程和法律规定，确保约定的合法性和有效性。
考虑税务和财务影响：部分股东偿还公司借款可能会涉及税务和财务方面的问题，如个人所得税、企业所得税等。因此，在制定约定时，应该充分考虑这些影响，并咨询专业的税务和财务顾问。
总结来说，公司向银行借款由部分股东来偿还的约定，在符合法律规定和公司章程的前提下，通常是有效的。但为了确保约定的有效性和避免潜在的法律风险，建议股东之间签订书面协议、获得债权人同意、遵守公司章程和法律规定，并考虑税务和财务影响。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。