结论：公司申请破产后是否需要偿还2000万欠款，需结合公司资产状况、债务性质及破产程序处理结果综合判断，并非简单以注册资金100万为限。以下是具体分析：

1. 破产清偿的核心原则：资产覆盖债务
   根据《企业破产法》，公司破产时需以全部现有资产（包括固定资产、流动资产、无形资产等）按法定顺序清偿债务，而非仅以注册资金为限。若公司资产经清算后价值超过2000万，则需全额偿还；若不足2000万，则按比例清偿，剩余债务可能因“资不抵债”被豁免。

2. 注册资金的作用与限制
   注册资金是公司设立时股东承诺的出资额，反映初始资本规模，但不直接决定破产清偿能力。例如：

   • 若公司经营中资产增值（如购置房产、设备），即使注册资金仅100万，资产总额可能远超2000万，需全额偿债；
     
   • 若公司长期亏损，资产已耗尽，即使注册资金100万未实缴，也仅需以现有资产（可能为零）清偿，剩余债务无需股东个人承担（除非存在抽逃出资、虚假出资等违法行为）。

3. 债务性质的影响

   • 普通债务：按破产程序比例清偿，未获清偿部分通常免除；
     
   • 特殊债务：如职工工资、社保、税款等优先清偿；若存在恶意逃废债、虚假破产等情形，相关责任人可能被追责。

4. 股东责任边界
   股东仅以出资额为限承担有限责任（即注册资金100万范围内）。若股东已足额出资，且无滥用公司法人地位等行为，无需以个人财产偿还公司债务；若未实缴出资，管理人可要求股东补缴出资用于偿债。

建议行动：

1. 立即委托律师或破产管理人梳理公司资产、负债清单，评估清偿能力；
   
2. 若资产不足，按法定程序申报债权，参与债权人会议争取权益；
   
3. 核查股东出资情况，防范因出资瑕疵被追责。
   

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