若公司在强制执行前主动履行了付款义务，债权人应及时向法院提交书面说明，并申请终止强制执行程序。以下是具体分析：

1. 法律效果
   根据《民事诉讼法》第264条，若被执行人（公司）在强制执行程序启动前主动履行了生效法律文书确定的义务（如支付欠款、赔偿金等），执行程序将因债务已清偿而失去启动基础。此时债权人需向法院提交《结案申请书》或书面说明，附上付款凭证（如银行转账记录、收据等），法院核实后会裁定终结执行程序。

2. 操作建议

   • 及时确认收款：收到款项后，务必核对金额是否与判决或调解书一致，避免因部分履行引发后续纠纷。
     
   • 书面确认履行：要求公司出具加盖公章的《履行完毕确认书》，明确债务已全额清偿，防止其事后反悔。
     
   • 申请终止执行：向执行法院提交书面申请，附上付款凭证和确认书，避免法院因不知情继续推进执行程序（如冻结账户、查封财产等）。
     

3. 特殊情形处理

   • 分期履行或部分履行：若公司仅履行部分义务，债权人可与对方协商剩余款项的支付计划，并要求法院出具《执行和解协议》或《分期履行通知书》。若公司未按协议履行，可随时申请恢复强制执行。
     
   • 履行瑕疵（如延迟、金额不足）：若公司履行存在瑕疵，债权人可在收到款项后15日内向法院提出异议，要求公司补足差额或承担违约责任（如逾期利息）。
     

提示：若公司以“私下和解”为由要求你撤回执行申请，务必谨慎处理。撤回申请后，若公司反悔，你需重新申请执行，且可能面临执行时效问题（申请执行时效为2年）。建议优先通过法院确认履行情况，再决定是否终止程序。

如有其他细节需要进一步分析（如付款方式、执行阶段等），可直接向我说明，我会结合具体情形为你解答。