结论：上市公司回复函后，证监会是否会去调查回复函，这并非一个绝对会发生或不会发生的事件，而是取决于多种因素的综合考量。

分析角度一：证监会的常规监管职责

证监会作为资本市场的监管机构，其职责之一就是确保上市公司的信息披露真实、准确、完整。当上市公司提交回复函时，这份文件构成了公司信息披露的一部分。因此，从常规监管的角度来看，证监会有可能对回复函进行审查，以确保其内容符合相关法律法规和监管要求。这种审查可能是随机的，也可能是基于特定风险或疑虑的针对性审查。

分析角度二：回复函的内容与性质

回复函的内容和性质也是决定证监会是否调查的重要因素。如果回复函涉及的是一些常规、无争议的问题，且内容清晰、合规，那么证监会可能不会进行深入调查。然而，如果回复函中包含了模糊、矛盾或可能引发误解的信息，或者涉及的是一些敏感、复杂的问题（如财务造假、内幕交易等），那么证监会很可能会启动调查程序，以核实信息的真实性和准确性。

分析角度三：市场反应与投资者关注

市场反应和投资者关注也是影响证监会决策的重要因素。如果回复函发布后，市场出现异常波动或投资者对回复函内容提出强烈质疑，那么证监会可能会出于维护市场秩序和保护投资者利益的考虑，对回复函进行调查。这种调查不仅有助于澄清事实，还能增强市场对监管机构的信任。

法律建议：

1. 确保回复函的真实性和准确性：上市公司在提交回复函前，应确保其内容真实、准确、完整，避免包含任何可能引发误解或质疑的信息。
2. 积极配合证监会的调查：如果证监会决定对回复函进行调查，上市公司应积极配合，提供必要的资料和解释，以协助证监会完成调查工作。
3. 加强内部合规管理：上市公司应建立健全内部合规管理制度，加强对信息披露的审核和监督，确保所有公开信息都符合相关法律法规和监管要求。

可能后果：

• 如果回复函内容合规且真实，那么即使证监会进行调查，也不会对上市公司产生不利影响。
• 如果回复函内容存在违规或虚假信息，那么证监会可能会采取相应的监管措施，如警告、罚款、责令改正等，甚至可能引发更严重的法律后果（如刑事责任）。

综上所述，上市公司在提交回复函后，应密切关注市场反应和监管动态，确保回复函的真实性和准确性，并积极配合证监会的调查工作。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。