结论：房子有贷款且存在违章建筑的情况下，违章建筑部分本身一般不能直接被冻结，但若违章建筑与合法房产存在不可分割性等特殊情形，可能会影响整个房产的处置，包括面临被限制交易等类似冻结效果的情况。以下为你详细分析：

从违章建筑本身角度

1. 违章建筑的法律属性：违章建筑是指未取得建设工程规划许可证或者违反建设工程规划许可证核定的相关内容建设的建筑。从法律层面来讲，违章建筑因其建设行为的违法性，其产权不受法律保护，不能像合法房产那样进行正常的产权登记和流转。所以，单纯就违章建筑部分而言，不存在像合法房产那样被司法冻结的概念。因为冻结通常是针对具有明确产权归属、能够进行产权登记的财产，而违章建筑无法完成合法的产权登记手续。
2. 处理方式：对于违章建筑，行政机关通常会依据相关法律法规进行查处，要求限期拆除、恢复原状或者处以罚款等行政处罚措施。例如，根据《中华人民共和国城乡规划法》第六十四条规定，未取得建设工程规划许可证或者未按照建设工程规划许可证的规定进行建设的，由县级以上地方人民政府城乡规划主管部门责令停止建设；尚可采取改正措施消除对规划实施的影响的，限期改正，处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款；无法采取改正措施消除影响的，限期拆除，不能拆除的，没收实物或者违法收入，可以并处建设工程造价百分之十以下的罚款。

从与合法房产关联角度

1. 不可分割情形：如果违章建筑与合法房产在物理上或者使用功能上存在不可分割性，例如违章建筑是合法房产的附属结构，拆除违章建筑会严重影响合法房产的安全和使用功能。在这种情况下，当涉及债务纠纷等法律问题时，虽然不能直接冻结违章建筑，但可能会对整个房产的处置产生影响。比如，债权人申请法院对债务人的房产进行保全时，由于违章建筑与合法房产的紧密关联，法院可能会对整个房产采取限制交易等措施，这类似于对房产进行了“冻结”，以保障债权人的利益。
2. 影响贷款及房产处置：存在违章建筑的房产在办理贷款时可能会遇到困难，银行在审批贷款时会对房产的合法性进行严格审查。如果房产存在违章建筑，银行可能会降低贷款额度、提高贷款利率或者拒绝发放贷款。在房产处置方面，由于违章建筑的存在，房产的市场价值会受到影响，而且在交易过程中可能会面临诸多法律障碍，导致房产难以顺利转让。例如，在司法拍卖中，存在违章建筑的房产可能会因为潜在的法律风险而无人问津，或者成交价格远低于市场正常水平。

应对建议

1. 主动处理违章建筑：如果房子存在违章建筑，建议尽快与当地城乡规划主管部门沟通，了解违章建筑的具体情况，并按照要求进行整改。如果能够通过补办相关手续使违章建筑合法化，那是最好的解决方式。例如，有些违章建筑是因为历史原因或者一些特殊情况导致的，在符合一定条件下可以补办建设工程规划许可证等手续。
2. 关注贷款情况：由于房子有贷款，要密切关注贷款合同中的相关条款以及银行的通知。如果因为违章建筑问题导致贷款出现异常，如银行要求提前还款等，要及时与银行协商解决。可以向银行说明正在积极处理违章建筑的情况，争取银行的理解和支持。
3. 应对法律纠纷：如果因债务等问题面临房产被保全或处置的情况，要及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务。律师可以根据具体情况，为你制定合理的应对策略，例如提出异议申请、参与协商调解等，以维护你的合法权益。

如果你还有其他关于房产法律方面的问题，欢迎随时向我咨询。