结论：骑摩托车时因遮挡牌照被交警拦停后选择逃跑，是严重的违法行为，将面临行政处罚、加重交通违法处理，甚至可能承担刑事责任。以下是对此行为的详细分析及建议：
一、法律后果
行政处罚：
- 根据《中华人民共和国治安管理处罚法》第五十条，阻碍国家机关工作人员依法执行职务的，处警告或者二百元以下罚款；情节严重的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款。逃跑行为明显阻碍了交警的执法活动，因此将受到相应的行政处罚。
- 同时，根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，对于故意遮挡、污损或者不按规定安装机动车号牌的违法行为，将面临罚款、记分等处罚。逃跑行为会作为从重情节纳入考量，导致罚款金额增加、记分提高。
交通违法处理加重：
- 逃跑行为本身会加重对原有交通违法行为的处罚。例如，如果原本只是因遮挡牌照被罚款和记分，逃跑后可能会面临更严厉的处罚，如吊销驾驶证等。
肇事逃逸责任升级（若逃跑过程中引发交通事故）：
- 若逃跑过程中引发交通事故，无论事故责任如何划分，均按肇事逃逸处理。根据《道路交通安全法》的相关规定，造成交通事故后逃逸，尚不构成犯罪的，将面临罚款、吊销机动车驾驶证或拘留等处罚。若构成犯罪，则需承担刑事责任。
二、其他潜在影响
车辆与证件风险：
- 被扣留的摩托车及行驶证可能因逃跑行为被依法没收，且后续补办手续将面临严格审查。
信用记录受损：
- 违法行为将被记入个人征信系统，影响贷款审批、职业准入等社会活动。
保险理赔障碍：
- 肇事逃逸属于商业保险免责条款，相关损失需自行承担。
三、建议与指导
主动配合执法：
- 当遇到交警拦截时，应主动停车并配合交警的检查工作。这是遵守法律法规的表现，也是对自己和他人负责的态度。
了解权利与义务：
- 在配合交警执法的过程中，了解自己的权利和义务是非常重要的。例如，有权要求交警出示执法证件，同时也有义务提供必要的证件和信息以便检查。
合法途径解决问题：
- 如果对交警的执法行为有异议或不满，应通过合法途径提出申诉或复议，而不是选择逃跑这种违法且危险的方式。
及时处理交通违法行为：
- 对于已经发生的交通违法行为，如遮挡牌照等，应及时到交警部门接受处理，避免问题进一步恶化。
示例说明：
假设你骑摩托车时因遮挡牌照被交警拦停，此时你应主动停车并配合检查。如果你选择逃跑，交警部门会利用监控等手段进行追查。一旦被找到，你将面临上述的行政处罚、交通违法处理加重等后果。如果逃跑过程中引发了交通事故，你还将承担肇事逃逸的责任，面临更严厉的处罚。
总结：骑摩托车时因遮挡牌照被交警拦停后选择逃跑是严重的违法行为，将带来一系列不良后果。因此，我建议你严格遵守交通法规，主动配合交警执法，共同维护良好的交通秩序和安全环境。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。