当主债务没有明确的还款期限，而保证期限约定为两年（但需注意，通常法律规定的默认保证期间为六个月，若双方确实约定为两年且不违反法律规定，则按约定执行，以下以一般法律原则及默认情况进行分析）时，保证期间的计算是一个涉及法律条款和实际操作的问题。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与基本原则
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，保证期间是确定保证人承担保证责任的期间，这个期间不发生中止、中断和延长。当主债务没有明确的履行期限时，保证期间的计算依赖于债权人给予债务人的宽限期。
二、保证期间的计算方式
有特别约定的情况：
- 如果债权人和保证人在保证合同中明确约定了保证期间为两年（且该约定不违反法律强制性规定，即不早于主债务履行期限或与主债务履行期限同时届满，并且在实际操作中，两年约定虽不常见但法律未禁止，只要双方合意即可），则按照约定的两年保证期间执行。但需注意，这种约定在实际操作中较为少见，因为通常法律规定的默认保证期间为六个月。
没有约定或约定不明确的情况（以法律默认的六个月保证期间为例进行说明，若确实约定为两年则按两年执行）：
- 当主债务没有明确的履行期限，且债权人与保证人未约定或约定不明确的保证期间时，保证期间的起算点依赖于债权人给予债务人的宽限期。
- 宽限期是债权人要求债务人履行债务所给予的合理准备时间。一旦宽限期届满，债务人仍未履行债务，则从宽限期届满之日起开始计算保证期间（若约定为两年则按两年，未约定则按法律默认的六个月）。
三、宽限期的确定与实际操作
- 宽限期的确定：宽限期通常由债权人根据实际情况决定，并应给予债务人合理的准备时间。它可以通过书面通知、交易习惯、行业惯例等方式明确。在实际操作中，债权人应尽可能以书面形式通知债务人，并明确宽限期的具体期限。
- 保证期间的起算：一旦宽限期届满，如果债务人未履行债务，债权人即可在保证期间内要求保证人承担保证责任。若保证期间约定为两年，则债权人有两年的时间来行使这一权利；若未约定，则按法律默认的六个月执行。
四、案例分析
假设债权人与债务人签订了一份借款合同，但未明确约定还款期限。随后，债权人与保证人签订了保证合同，约定保证期间为两年（或未约定保证期间）。在这种情况下：
- 如果约定了两年保证期间：债权人应在发现债务人未履行债务后，及时与债务人协商确定宽限期，并在宽限期届满后两年内要求保证人承担保证责任。
- 如果未约定保证期间：债权人同样应与债务人协商确定宽限期，并在宽限期届满后六个月内要求保证人承担保证责任。若超过这个期限，保证人可能不再承担保证责任。
五、建议与注意事项
- 债权人应及时与债务人协商确定还款期限或宽限期，并以书面形式记录下来，以确保自身权益不受损害。
- 保证人应密切关注债权人与债务人之间的约定，特别是关于宽限期和保证期间的约定，以便在必要时承担相应的保证责任。
- 如遇复杂情况或争议，建议咨询专业法律顾问，以获取准确的法律建议和帮助。
综上所述，当主债务没有明确的还款期限时，保证期间的计算依赖于债权人给予债务人的宽限期以及债权人与保证人之间的约定。在实际操作中，各方应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保自身权益得到充分保障。