结论：在民间借贷中，若借款总额为100万元，您确实可以选择仅就其中的50万元进行起诉。不过，这一选择需基于一定的法律考量和实践操作，以下我将从多个角度为您详细分析。

1. 法律原则与规定：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，原告有权选择起诉的标的额和范围。这意味着，在民间借贷纠纷中，如果您认为部分借款（如50万元）的归还存在问题，您完全有权仅就这部分金额提起诉讼，而无需将全部借款（100万元）都纳入诉讼范围。

2. 诉讼策略与成本考虑：

   • 诉讼成本：选择起诉部分金额可能有助于降低诉讼成本，包括律师费、诉讼费等。如果全部借款都纳入诉讼，这些费用可能会相应增加。
   • 诉讼效率：仅就部分金额起诉可能使诉讼过程更加简洁高效，因为涉及的金额较小，证据收集和审理过程可能相对简单。
   • 风险分散：如果全部借款都纳入同一诉讼，一旦败诉，您可能需要承担全部借款的还款责任。而选择部分起诉，即使败诉，也仅需承担该部分借款的还款责任，从而在一定程度上分散了风险。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 证据收集：无论选择起诉多少金额，都需要确保有充分的证据来支持您的主张。这包括借款合同、转账记录、聊天记录等能够证明借款事实和金额的证据。
   • 诉讼时效：需要注意诉讼时效的问题。根据《中华人民共和国民法典》的规定，民间借贷的诉讼时效通常为三年。因此，在决定起诉前，请确保您的债权仍在诉讼时效期内。
   • 被告的还款能力：在选择起诉金额时，也需要考虑被告的还款能力。如果被告经济状况不佳，即使您赢得了诉讼，也可能面临执行困难的问题。

4. 可能面临的法律后果：

   • 如果您选择仅就50万元起诉，并且法院最终支持了您的主张，那么被告将需要承担这50万元的还款责任。同时，您也有权在后续就剩余的50万元继续提起诉讼（如果符合诉讼时效等条件）。
   • 另一方面，如果您在诉讼过程中发现被告有其他财产或收入来源，您也可以考虑在诉讼中申请财产保全等措施，以确保判决能够得到有效执行。

建议：在决定仅就部分金额起诉前，建议您先咨询专业律师（即我，吕巧梅律师）的意见。我可以根据您的具体情况和证据材料，为您提供更具体的法律建议和诉讼策略。同时，也请您务必注意诉讼时效和证据收集的问题，以确保您的权益能够得到有效维护。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。