在计算机软件开发合同纠纷中，证据种类主要包括以下几类：
合同文本及附件：
- 这是最直接且关键的证据，包括双方签订的计算机软件开发合同正本、副本以及任何相关的补充协议或附件。合同文本中应明确双方的权利义务、开发内容、开发周期、验收标准、付款方式等关键条款。
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》合同编的相关规定，合同是双方意思表示一致的协议，是确定双方权利义务的依据。
开发过程中的沟通记录：
- 包括电子邮件、即时通讯工具（如微信、QQ）的聊天记录、会议纪要等，这些记录能够反映双方在开发过程中的沟通情况、需求变更、问题解决等关键信息。
- 法律建议：建议双方在开发过程中保持书面沟通，并妥善保存所有沟通记录，以便在发生纠纷时作为证据使用。
开发成果及验收记录：
- 包括软件源代码、文档、测试报告、用户手册等开发成果，以及双方签署的验收报告或确认书。这些证据能够证明开发方是否按照合同约定完成了开发任务，并达到了验收标准。
- 法律后果：如果开发方未能提供符合合同约定的开发成果，或者验收不合格，可能构成违约，需要承担相应的法律责任。
付款凭证及发票：
- 包括银行转账记录、收据、发票等，这些证据能够证明双方之间的资金往来情况，以及开发方是否已按照合同约定收到了相应的款项。
- 法律背景：根据《中华人民共和国税收征收管理法》等相关规定，发票是交易双方经济往来的重要凭证，也是税务机关征税的重要依据。
第三方鉴定或评估报告：
- 在某些情况下，双方可能对开发成果的质量、性能等存在争议，此时可以委托第三方机构进行鉴定或评估，并出具相应的报告作为证据。
- 法律建议：在选择第三方机构时，应确保其具有相应的资质和信誉，以保证鉴定或评估结果的公正性和准确性。
其他相关证据：
- 根据具体情况，还可能包括其他与合同纠纷相关的证据，如双方签署的保密协议、知识产权归属协议等。
- 法律提示：在签订和履行计算机软件开发合同时，双方应充分考虑各种可能的风险，并在合同中明确约定相应的条款和条件，以减少纠纷的发生。
在处理计算机软件开发合同纠纷时，建议双方首先尝试通过协商解决争议。如果协商无果，可以寻求法律途径解决，如向法院提起诉讼或申请仲裁。在此过程中，证据的收集和整理至关重要，它将直接影响到案件的胜诉与否。因此，双方应高度重视证据的保存和整理工作，确保在发生纠纷时能够提供充分、有效的证据支持自己的主张。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。