结论概述：以房抵债后，借款的诉讼时效问题需结合抵债协议的性质及履行情况来综合判断。若抵债协议被认定为新的债权债务关系，则诉讼时效从协议签订或履行期限届满之日起重新计算；若抵债协议仅作为原借款的担保，则诉讼时效仍受原借款合同诉讼时效的约束。

详细分析：

1. 抵债协议作为新的债权债务关系：

   • 法律背景：当双方签订以房抵债协议，且该协议被视为对原借款的清偿方式进行了变更，即双方同意以房屋所有权转移来替代原借款的偿还时，该协议可能构成一个新的债权债务关系。
   • 诉讼时效：在此情况下，借款的诉讼时效将从抵债协议签订之日起或协议约定的履行期限届满之日起重新计算。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，若抵债协议签订后三年内未行使权利，则可能丧失胜诉权。
   • 建议：为确保权益，建议在抵债协议签订后及时关注诉讼时效问题，并在必要时采取法律措施维护自身权益。

2. 抵债协议作为原借款的担保：

   • 法律背景：若双方签订以房抵债协议，但该协议仅作为原借款的担保措施，即当借款人无法按时偿还借款时，出借人有权要求以房屋所有权转移来抵偿借款，则该协议并不构成一个新的债权债务关系。
   • 诉讼时效：在此情况下，借款的诉讼时效仍受原借款合同诉讼时效的约束。即，若原借款合同约定的诉讼时效未届满，则出借人仍有权在诉讼时效期间内要求借款人偿还借款。
   • 建议：对于此类情况，建议出借人密切关注原借款合同的诉讼时效问题，并在必要时及时采取法律措施，如提起诉讼或申请仲裁等，以维护自身权益。

特殊情况考虑：

• 抵债协议的履行情况：若抵债协议签订后，双方已实际履行了房屋所有权转移等义务，则可能视为原借款已得到清偿，此时不再存在借款诉讼时效的问题。
• 诉讼时效的中断与中止：在诉讼时效期间内，若因特定事由（如借款人同意履行义务、出借人向借款人提出履行请求等）导致诉讼时效中断或中止的，则诉讼时效将重新计算或暂停计算。

行动建议：

• 审查抵债协议：首先，应仔细审查以房抵债协议的具体内容，明确其性质及双方的权利义务关系。
• 关注诉讼时效：根据抵债协议的性质及履行情况，及时关注借款的诉讼时效问题，并在必要时采取法律措施维护自身权益。
• 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。